RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C RRT14P40470 206 aa2.96□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C MNN10P50108 393 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C YGR053CP53234 283 aa2.96□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C MSC2Q03455 724 aa2.96□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C NAB6Q03735 1134 aaKnown RBP RIP-Chip data2.96□□□□□ -1.94not detected
HDA3YPR179C ACK1Q07622 623 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C SVS1Q12254 260 aa2.96□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C TAD3Q9URQ3 322 aa2.96□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C KIN2P13186 1147 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C PEP7P32609 515 aa2.95□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C UGA2P38067 497 aa2.95□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C MTC3P53077 123 aa2.95□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C ACM1Q08981 209 aa2.95□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C PET112P33893 541 aa2.94□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C LST4P34239 828 aa2.94□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C VPS62P53285 467 aa2.94□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C GPB1Q08886 897 aa2.94□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C RKM4Q12504 494 aa2.94□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C BI4P03879 638 aa2.94□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C CMP2P14747 604 aa2.94□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C MCM7P38132 845 aa2.94□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C SIP5P40210 489 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C MSE1P48525 536 aa2.94□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C HCM1P25364 564 aa2.93□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C PMI40P29952 429 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C YKL151CP36059 337 aa2.93□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C HFM1P51979 1187 aa2.93□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C TYW3P53177 273 aa2.93□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C MAP1Q01662 387 aaKnown RBP RIP-Chip data2.93□□□□□ -1.94not detected
HDA3YPR179C YLL058WQ12198 575 aa2.93□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C NTO1Q12311 748 aa2.93□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C THS1P04801 734 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C INO1P11986 533 aa2.92□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C DCG1P32460 244 aa2.92□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C SLI1P53304 468 aa2.92□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C NOP12Q08208 459 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C HMI1Q12039 706 aa2.92□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C APL1P27351 700 aa2.92□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C MCM6P53091 1017 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C VTS1Q08831 523 aaKnown RBP RIP-Chip data2.92□□□□□ -1.94not detected
HDA3YPR179C PMA1P05030 918 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C CTF4Q01454 927 aa2.91□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C SPP382Q06411 708 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C ADY3Q07732 790 aa2.91□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C XYL2Q07993 356 aa2.91□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C MOT2P34909 587 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C YAP1801P38856 637 aa2.91□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C MND2P40577 368 aa2.91□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C YGL176CP46945 554 aa2.91□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C FAA4P47912 694 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C YLR224WQ05947 369 aa2.91□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C PIN2Q12057 282 aa2.91□□□□□ -1.94
HDA3YPR179C YKL107WP34251 309 aa2.9□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C MET12P46151 657 aa2.9□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C HRQ1Q05549 1077 aa2.9□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C TMA10Q06177 86 aa2.9□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C AGP1P25376 633 aa2.89□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C PIN4P34217 668 aaKnown RBP RIP-Chip data2.89□□□□□ -1.95not detected
HDA3YPR179C DEF1P35732 738 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C CHA4P43634 648 aa2.89□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C SUN4P53616 420 aa2.89□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C VPS16Q03308 798 aa2.89□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C YAP6Q03935 383 aa2.89□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C SPO20Q04359 397 aa2.89□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C SVF1Q05515 481 aa2.89□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C YLR225CQ05948 407 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C ESC2Q06340 456 aa2.89□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C MDM38Q08179 573 aa2.89□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C RPP2AP05319 106 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C EMC1P25574 760 aa2.89□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C GIC1P38785 314 aa2.89□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C CHS7P38843 316 aa2.89□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C IOC3P43596 787 aa2.89□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C SRT1Q03175 343 aa2.89□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C CDA1Q06702 301 aa2.89□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C TPO1Q07824 586 aa2.89□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C SBA1P28707 216 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C FUN30P31380 1131 aa2.88□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C NPP2P39997 493 aa2.88□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C AIM21P40563 679 aa2.88□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C PHO23P50947 330 aa2.88□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C HIS5P07172 385 aa2.87□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C NAP1P25293 417 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C CDC12P32468 407 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C ABD1P32783 436 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C YPT53P36019 220 aa2.87□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C ECM21P38167 1117 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C SNF7P39929 240 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C GCV2P49095 1034 aa2.87□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C GTF1P53260 183 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C GDE1Q02979 1223 aa2.87□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C CLN2P20438 545 aa2.87□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C RAD53P22216 821 aa2.87□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C PLB1P39105 664 aa2.87□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C ZRG8P40021 1076 aa2.87□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C URM1P40554 99 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C EXG2P52911 562 aa2.87□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C SHE9Q04172 456 aa2.87□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C POA1P38218 177 aa2.86□□□□□ -1.95
HDA3YPR179C YBR238CP38330 731 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
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