RNA–Protein interactions for RNA: YMR066W

SOV1, Transcript of Mitochondrial protein of unknown function, yeast

Gene SOV1, Length 2,697 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SOV1	YMR066W	SUN4	P53616	420 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	SSL2	Q00578	843 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	KIN4	Q01919	800 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	RSC4	Q02206	625 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	RPN13	O13563	156 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	HIS5	P07172	385 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	ABF1	P14164	731 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	BAS1	P22035	811 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	RPB10	P22139	70 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	TSR4	P25040	408 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	ERG4	P25340	473 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	KCC4	P25389	1037 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	RPC82	P32349	654 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.44	□□□□□ -2.34	not detected
SOV1	YMR066W	ALG3	P38179	458 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	RRT14	P40470	206 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.44	□□□□□ -2.34	not detected
SOV1	YMR066W	AAT1	Q01802	451 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	EAR1	Q03212	550 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	PKH1	Q03407	766 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	ADI1	Q03677	179 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	RSC3	Q06639	885 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	IRC3	Q06683	689 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	PEX19	Q07418	342 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	TPO1	Q07824	586 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	GPI13	Q07830	1017 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	NTO1	Q12311	748 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	CYB2	P00175	591 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	ALG7	P07286	448 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	MLS1	P30952	554 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	YKL107W	P34251	309 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	TFA2	P36145	328 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	YRO2	P38079	344 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	YHL017W	P38745	532 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	PCL5	P38794	229 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	CNN1	P43618	361 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	CTR1	P49573	406 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	YGR012W	P53206	393 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	ULP1	Q02724	621 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	IRC10	Q08118	586 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	ACM1	Q08981	209 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	GNT1	Q12096	491 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	CDC20	P26309	610 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	SRP101	P32916	621 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	DOM34	P33309	386 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	GLG1	P36143	616 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	SCO2	P38072	301 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	THI6	P41835	540 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	ENT3	P47160	408 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	GCV2	P49095	1034 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	AMA1	P50082	593 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	STB4	P50104	949 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	YAP1802	P53309	568 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	RIA1	P53893	1110 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	ORC4	P54791	529 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	OMS1	Q06668	471 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	ENB1	Q08299	606 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	HVG1	P0CE11	249 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	EUG1	P32474	517 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	SUV3	P32580	737 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	UGA2	P38067	497 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	RIM11	P38615	370 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	NEM1	P38757	446 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	ARG2	P40360	574 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	CEP3	P40969	608 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	PHO23	P50947	330 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	COX18	P53239	316 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	GND2	P53319	492 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	FMP30	Q02883	468 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	NRG1	Q03125	231 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	YAP6	Q03935	383 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	YML083C	Q04526	418 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	YDR306C	Q06640	478 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	SPO75	Q07798	868 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	XYL2	Q07993	356 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	YOL073C	Q08232	322 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	RTT10	Q08924	1013 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	GUP2	Q08929	609 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	ICT1	Q12385	394 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	OSH2	Q12451	1283 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	PRC1	P00729	532 aa		0.42	□□□□□ -2.34

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