RNA–Protein interactions for RNA: YJL135W

YJL135W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YJL135W, Length 318 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJL135W	YJL135W	POA1	P38218	177 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	SUL1	P38359	859 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	DAK2	P43550	591 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	CHA4	P43634	648 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	YLR040C	Q07988	224 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	SLD2	P34252	453 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	MTH1	P35198	433 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	YGL140C	P53120	1219 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	YGR122W	P53272	402 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	2.85	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	MCD1	Q12158	566 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	KTR4	P38131	464 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	SEC5	P89102	971 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	DAL4	Q04895	635 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	COQ11	Q05892	277 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	KCS1	Q12494	1050 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YJL135W	YJL135W	YFL054C	P43549	646 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YJL135W	YJL135W	RMD1	Q03441	430 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YJL135W	YJL135W	WHI5	Q12416	295 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YJL135W	YJL135W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
YJL135W	YJL135W	MDM10	P18409	493 aa		2.82	□□□□□ -1.96
YJL135W	YJL135W	PEX2	P32800	271 aa		2.82	□□□□□ -1.96
YJL135W	YJL135W	SPC42	P36094	363 aa		2.82	□□□□□ -1.96
YJL135W	YJL135W	BUL1	P48524	976 aa		2.82	□□□□□ -1.96
YJL135W	YJL135W	SIW14	P53965	281 aa		2.82	□□□□□ -1.96
YJL135W	YJL135W	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	2.82	□□□□□ -1.96
YJL135W	YJL135W	ACE2	P21192	770 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YJL135W	YJL135W	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
YJL135W	YJL135W	PIC2	P40035	300 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YJL135W	YJL135W	MRPS18	P42847	217 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YJL135W	YJL135W	YJR107W	P47145	328 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YJL135W	YJL135W	GNP1	P48813	663 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YJL135W	YJL135W	GND2	P53319	492 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YJL135W	YJL135W	LAS17	Q12446	633 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YJL135W	YJL135W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YJL135W	YJL135W	CYC8	P14922	966 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YJL135W	YJL135W	HEM3	P28789	327 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YJL135W	YJL135W	ASF1	P32447	279 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YJL135W	YJL135W	UGA4	P32837	571 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YJL135W	YJL135W	RGD1	P38339	666 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YJL135W	YJL135W	FAA3	P39002	694 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YJL135W	YJL135W	ZRG8	P40021	1076 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YJL135W	YJL135W	IMO32	P53219	342 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YJL135W	YJL135W	TOS4	Q06266	489 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YJL135W	YJL135W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	2.8	□□□□□ -1.96
YJL135W	YJL135W	RAD2	P07276	1031 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YJL135W	YJL135W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
YJL135W	YJL135W	MGE1	P38523	228 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YJL135W	YJL135W	HXT13	P39924	564 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YJL135W	YJL135W	RRT14	P40470	206 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YJL135W	YJL135W	GLO1	P50107	326 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YJL135W	YJL135W	HXT17	P53631	564 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YJL135W	YJL135W	HXT15	P54854	567 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YJL135W	YJL135W	YMR206W	Q03695	313 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YJL135W	YJL135W	ERG4	P25340	473 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YJL135W	YJL135W	SEC8	P32855	1065 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YJL135W	YJL135W	IPL1	P38991	367 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YJL135W	YJL135W	RNT1	Q02555	471 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YJL135W	YJL135W	GUP2	Q08929	609 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YJL135W	YJL135W	NPC2	Q12408	173 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YJL135W	YJL135W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	MKK2	P32491	506 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	CNN1	P43618	361 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	MUK1	Q02866	612 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.77	□□□□□ -1.97	not detected
YJL135W	YJL135W	YER152C	P10356	443 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	ENA1	P13587	1091 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	BAS1	P22035	811 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	SDS3	P40505	327 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	THI12	P42883	340 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	THI5	P43534	340 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	THI11	P47183	340 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	ENA2	Q01896	1091 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	THI13	Q07748	340 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	RTT10	Q08924	1013 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	ENA5	Q12691	1091 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	KAR4	P25583	335 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	MNR2	P35724	969 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	MPH1	P40562	993 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	POL32	P47110	350 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	GNT1	Q12096	491 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	BNR1	P40450	1375 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	PPZ2	P33329	710 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	GEM1	P39722	662 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	HFM1	P51979	1187 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	SCS3	P53012	380 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	NCS6	P53088	359 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	ROD1	Q02805	837 aa		2.74	□□□□□ -1.97

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