RNA–Protein interactions for RNA: Q0140

VAR1, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene VAR1, Length 1,197 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	Q0140	ENA1	P13587	1091 aa		6.36	□□□□□ -1.39
VAR1	Q0140	TMT1	P32643	299 aa		6.36	□□□□□ -1.39
VAR1	Q0140	ENA2	Q01896	1091 aa		6.36	□□□□□ -1.39
VAR1	Q0140	TOS4	Q06266	489 aa		6.36	□□□□□ -1.39
VAR1	Q0140	ENA5	Q12691	1091 aa		6.36	□□□□□ -1.39
VAR1	Q0140	BAS1	P22035	811 aa		6.35	□□□□□ -1.39
VAR1	Q0140	KTR4	P38131	464 aa		6.35	□□□□□ -1.39
VAR1	Q0140	NPC2	Q12408	173 aa		6.35	□□□□□ -1.39
VAR1	Q0140	YPL109C	Q02981	657 aa		6.34	□□□□□ -1.39
VAR1	Q0140	HFM1	P51979	1187 aa		6.33	□□□□□ -1.4
VAR1	Q0140	ERG4	P25340	473 aa		6.32	□□□□□ -1.4
VAR1	Q0140	BNR1	P40450	1375 aa		6.31	□□□□□ -1.4
VAR1	Q0140	ROD1	Q02805	837 aa		6.31	□□□□□ -1.4
VAR1	Q0140	BI4	P03879	638 aa		6.3	□□□□□ -1.4
VAR1	Q0140	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
VAR1	Q0140	KAR4	P25583	335 aa		6.3	□□□□□ -1.4
VAR1	Q0140	RGD1	P38339	666 aa		6.3	□□□□□ -1.4
VAR1	Q0140	ERP5	P38819	212 aa		6.3	□□□□□ -1.4
VAR1	Q0140	XYL2	Q07993	356 aa		6.3	□□□□□ -1.4
VAR1	Q0140	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
VAR1	Q0140	MLS1	P30952	554 aa		6.29	□□□□□ -1.4
VAR1	Q0140	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
VAR1	Q0140	UGA2	P38067	497 aa		6.29	□□□□□ -1.4
VAR1	Q0140	PIC2	P40035	300 aa		6.29	□□□□□ -1.4
VAR1	Q0140	VPS35	P34110	944 aa		6.28	□□□□□ -1.4
VAR1	Q0140	RRT14	P40470	206 aa		6.28	□□□□□ -1.4
VAR1	Q0140	MKK2	P32491	506 aa		6.27	□□□□□ -1.41
VAR1	Q0140	IMO32	P53219	342 aa		6.27	□□□□□ -1.41
VAR1	Q0140	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.27	□□□□□ -1.41	not detected
VAR1	Q0140	SUT2	Q12286	268 aa		6.27	□□□□□ -1.41
VAR1	Q0140	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		6.27	□□□□□ -1.41
VAR1	Q0140	COQ11	Q05892	277 aa		6.26	□□□□□ -1.41
VAR1	Q0140	MXR1	P40029	184 aa		6.25	□□□□□ -1.41
VAR1	Q0140	NCS6	P53088	359 aa		6.25	□□□□□ -1.41
VAR1	Q0140	SDS3	P40505	327 aa		6.24	□□□□□ -1.41
VAR1	Q0140	RNT1	Q02555	471 aa		6.24	□□□□□ -1.41
VAR1	Q0140	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
VAR1	Q0140	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
VAR1	Q0140	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
VAR1	Q0140	PPZ2	P33329	710 aa		6.23	□□□□□ -1.41
VAR1	Q0140	HAT1	Q12341	374 aa		6.22	□□□□□ -1.41
VAR1	Q0140	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		6.22	□□□□□ -1.41
VAR1	Q0140	TAF13	P11747	167 aa		6.21	□□□□□ -1.42
VAR1	Q0140	FAA3	P39002	694 aa		6.21	□□□□□ -1.42
VAR1	Q0140	SEC5	P89102	971 aa		6.21	□□□□□ -1.42
VAR1	Q0140	TRM13	Q12383	476 aa		6.21	□□□□□ -1.42
VAR1	Q0140	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	6.2	□□□□□ -1.42
VAR1	Q0140	SPE1	P08432	466 aa		6.2	□□□□□ -1.42
VAR1	Q0140	GLO1	P50107	326 aa		6.2	□□□□□ -1.42
VAR1	Q0140	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	6.2	□□□□□ -1.42
VAR1	Q0140	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
VAR1	Q0140	YGR012W	P53206	393 aa		6.19	□□□□□ -1.42
VAR1	Q0140	ALG7	P07286	448 aa		6.18	□□□□□ -1.42
VAR1	Q0140	CDA1	Q06702	301 aa		6.18	□□□□□ -1.42
VAR1	Q0140	GUP2	Q08929	609 aa		6.18	□□□□□ -1.42
VAR1	Q0140	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	6.17	□□□□□ -1.42
VAR1	Q0140	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	6.17	□□□□□ -1.42
VAR1	Q0140	GEF1	P37020	779 aa		6.17	□□□□□ -1.42
VAR1	Q0140	ACM1	Q08981	209 aa		6.17	□□□□□ -1.42
VAR1	Q0140	SIW14	P53965	281 aa		6.16	□□□□□ -1.42
VAR1	Q0140	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	6.15	□□□□□ -1.42
VAR1	Q0140	FLO10	P36170	1169 aa		6.15	□□□□□ -1.42
VAR1	Q0140	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	6.15	□□□□□ -1.42
VAR1	Q0140	CNN1	P43618	361 aa		6.15	□□□□□ -1.42
VAR1	Q0140	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	6.15	□□□□□ -1.42
VAR1	Q0140	OXR1	Q08952	273 aa		6.15	□□□□□ -1.42
VAR1	Q0140	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	6.14	□□□□□ -1.43
VAR1	Q0140	SLA2	P33338	968 aa		6.14	□□□□□ -1.43
VAR1	Q0140	SCS3	P53012	380 aa		6.14	□□□□□ -1.43
VAR1	Q0140	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
VAR1	Q0140	TDP1	P38319	544 aa		6.13	□□□□□ -1.43
VAR1	Q0140	YHL050C	P38721	697 aa		6.13	□□□□□ -1.43
VAR1	Q0140	YAP1801	P38856	637 aa		6.13	□□□□□ -1.43
VAR1	Q0140	YHR219W	P38900	624 aa		6.13	□□□□□ -1.43
VAR1	Q0140	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
VAR1	Q0140	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	6.13	□□□□□ -1.43
VAR1	Q0140	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
VAR1	Q0140	HXT13	P39924	564 aa		6.12	□□□□□ -1.43
VAR1	Q0140	MPH1	P40562	993 aa		6.12	□□□□□ -1.43
VAR1	Q0140	MTC3	P53077	123 aa		6.12	□□□□□ -1.43
VAR1	Q0140	HXT17	P53631	564 aa		6.12	□□□□□ -1.43
VAR1	Q0140	HXT15	P54854	567 aa		6.12	□□□□□ -1.43
VAR1	Q0140	THI7	Q05998	598 aa		6.12	□□□□□ -1.43
VAR1	Q0140	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
VAR1	Q0140	SRP101	P32916	621 aa		6.11	□□□□□ -1.43
VAR1	Q0140	CCC2	P38995	1004 aa		6.1	□□□□□ -1.43
VAR1	Q0140	ENT3	P47160	408 aa		6.1	□□□□□ -1.43
VAR1	Q0140	GEM1	P39722	662 aa		6.09	□□□□□ -1.43
VAR1	Q0140	OSW2	Q12202	724 aa		6.09	□□□□□ -1.43
VAR1	Q0140	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
VAR1	Q0140	MET4	P32389	672 aa		6.07	□□□□□ -1.44
VAR1	Q0140	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
VAR1	Q0140	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
VAR1	Q0140	PPX1	P38698	397 aa		6.05	□□□□□ -1.44
VAR1	Q0140	SEC8	P32855	1065 aa		6.04	□□□□□ -1.44
VAR1	Q0140	PPS1	P38148	807 aa		6.04	□□□□□ -1.44
VAR1	Q0140	TAH11	P47112	604 aa		6.04	□□□□□ -1.44
VAR1	Q0140	GNP1	P48813	663 aa		6.03	□□□□□ -1.44
VAR1	Q0140	HSF1	P10961	833 aa		6.02	□□□□□ -1.45
VAR1	Q0140	GNT1	Q12096	491 aa		6.02	□□□□□ -1.45

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