RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548092.5

TRAFD1-204, Transcript of TRAF-type zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRAFD1, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1-204ENST00000548092 PLPP7Q8NBV4 271 aa7.4□□□□□ -1.22
TRAFD1-204ENST00000548092 ALG2Q9H553 416 aa7.4□□□□□ -1.22
TRAFD1-204ENST00000548092 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa7.4□□□□□ -1.22
TRAFD1-204ENST00000548092 WASLO00401 505 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
TRAFD1-204ENST00000548092 THBS1P07996 1170 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAFD1-204ENST00000548092 WDR44Q5JSH3 913 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAFD1-204ENST00000548092 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
TRAFD1-204ENST00000548092 LTBP4Q8N2S1 1624 aa7.38□□□□□ -1.23
TRAFD1-204ENST00000548092 ADAMTS2O95450 1211 aa7.38□□□□□ -1.23
TRAFD1-204ENST00000548092 SCNN1DP51172 638 aa7.38□□□□□ -1.23
TRAFD1-204ENST00000548092 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
TRAFD1-204ENST00000548092 ADAMTS8Q9UP79 889 aa7.38□□□□□ -1.23
TRAFD1-204ENST00000548092 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
TRAFD1-204ENST00000548092 POM121CA8CG34 1229 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAFD1-204ENST00000548092 F11P03951 625 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAFD1-204ENST00000548092 GSK3AP49840 483 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAFD1-204ENST00000548092 MAP7D1Q3KQU3 841 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAFD1-204ENST00000548092 C4orf17Q53FE4 359 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAFD1-204ENST00000548092 LYPD4Q6UWN0 246 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAFD1-204ENST00000548092 CUL7Q14999 1698 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAFD1-204ENST00000548092 YEATS2Q9ULM3 1422 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAFD1-204ENST00000548092 ARHGEF15O94989 841 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAFD1-204ENST00000548092 SOX11P35716 441 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAFD1-204ENST00000548092 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
TRAFD1-204ENST00000548092 ESCO1Q5FWF5 840 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAFD1-204ENST00000548092 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
TRAFD1-204ENST00000548092 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAFD1-204ENST00000548092 GMCL1Q96IK5 515 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAFD1-204ENST00000548092 GPAMQ9HCL2 828 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAFD1-204ENST00000548092 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAFD1-204ENST00000548092 TMEM229AB2RXF0 380 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAFD1-204ENST00000548092 INHAP05111 366 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAFD1-204ENST00000548092 GDF10P55107 478 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAFD1-204ENST00000548092 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TRAFD1-204ENST00000548092 SIRT1Q96EB6 747 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAFD1-204ENST00000548092 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAFD1-204ENST00000548092 STRCQ7RTU9 1775 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAFD1-204ENST00000548092 H7C1W4 665 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAFD1-204ENST00000548092 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TRAFD1-204ENST00000548092 TLR1Q15399 786 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAFD1-204ENST00000548092 SVOPQ8N4V2 548 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAFD1-204ENST00000548092 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TRAFD1-204ENST00000548092 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAFD1-204ENST00000548092 ERICH3Q5RHP9 1530 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 SKIP12755 728 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 MBIPQ9NS73 344 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 SERTAD1Q9UHV2 236 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 USP3Q9Y6I4 520 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 PTPRGP23470 1445 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 IGF1RP08069 1367 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 UBTFP17480 764 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 MSX1P28360 303 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 KCNMA1Q12791 1236 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 FLIIQ13045 1269 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 GNASQ5JWF2 1037 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 DEPDC4Q8N2C3 294 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 RHBDD1Q8TEB9 315 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 RUBCNLQ9H714 662 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 PTPRTO14522 1441 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 CFAP43Q8NDM7 1665 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 A0A1B0GTH6 734 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 RAD21O60216 631 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 SMTNP53814 917 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 TMEM132AQ24JP5 1023 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 FOXR1Q6PIV2 292 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 CLUAP1Q96AJ1 413 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 ARAP3Q8WWN8 1544 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 KDM5BQ9UGL1 1544 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 NCOA4Q13772 614 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 ACDQ96AP0 544 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 SLC4A9Q96Q91 983 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 CD109Q6YHK3 1445 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 UBAP1LF5GYI3 381 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 MX2P20592 715 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 PLA2G4AP47712 749 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 EML3Q32P44 896 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 TRERF1Q96PN7 1200 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 UCN2Q96RP3 112 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 WDR7Q9Y4E6 1490 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 PREX1Q8TCU6 1659 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 A6NJY4 79 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 MTFR1Q15390 333 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 CFHR5Q9BXR6 569 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 NOD1Q9Y239 953 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAFD1-204ENST00000548092 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
TRAFD1-204ENST00000548092 USP17L5A8MUK1 530 aa7.27□□□□□ -1.25
TRAFD1-204ENST00000548092 C2CD2LO14523 706 aa7.27□□□□□ -1.25
TRAFD1-204ENST00000548092 BNIP3LO60238 219 aa7.27□□□□□ -1.25
TRAFD1-204ENST00000548092 HSPA1LP34931 641 aa7.27□□□□□ -1.25
TRAFD1-204ENST00000548092 GTF2IP78347 998 aa7.27□□□□□ -1.25
TRAFD1-204ENST00000548092 RASSF7Q02833 373 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms