RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513542.1

SMAD1-AS1-201, SMAD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SMAD1-AS1, Length 481 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 KRT24Q2M2I5 525 aa17.45■□□□□ 0.38
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CCDC87Q9NVE4 849 aa17.45■□□□□ 0.38
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa17.45■□□□□ 0.38
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ZNF521Q96K83 1311 aa17.45■□□□□ 0.38
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 LRP5O75197 1615 aa17.44■□□□□ 0.38
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 GNAI1P63096 354 aa17.44■□□□□ 0.38
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 USP16Q9Y5T5 823 aa17.44■□□□□ 0.38
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 BCORQ6W2J9 1755 aa17.43■□□□□ 0.38
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SCN7AQ01118 1682 aa17.43■□□□□ 0.38
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 IL16Q14005 1332 aa17.43■□□□□ 0.38
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 RPS6KA4O75676 772 aa17.42■□□□□ 0.38
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 STARD3NLO95772 234 aa17.42■□□□□ 0.38
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SSFA2P28290 1259 aa17.42■□□□□ 0.38
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 NGEFQ8N5V2 710 aa17.42■□□□□ 0.38
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa17.42■□□□□ 0.38
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ZBTB7AO95365 584 aa17.41■□□□□ 0.38
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 A1BGP04217 495 aa17.41■□□□□ 0.38
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 WDR63Q8IWG1 891 aa17.41■□□□□ 0.38
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 COL15A1P39059 1388 aa17.4■□□□□ 0.38
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 MSH5O43196 834 aa17.4■□□□□ 0.38
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CANXP27824 592 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 FANCIQ9NVI1 1328 aa17.4■□□□□ 0.38
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 NBPF26B4DH59 902 aa17.38■□□□□ 0.37
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ADRA2BP18089 450 aa17.38■□□□□ 0.37
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 NBPF15Q8N660 670 aa17.38■□□□□ 0.37
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 FLAD1Q8NFF5 587 aa17.38■□□□□ 0.37
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TRAPPC3LQ5T215 181 aa17.37■□□□□ 0.37
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 MSL1Q68DK7 614 aa17.37■□□□□ 0.37
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 C8orf58Q8NAV2 365 aa17.37■□□□□ 0.37
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 EIF5P55010 431 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP17.36■□□□□ 0.37
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 DUSP27Q5VZP5 1158 aa17.36■□□□□ 0.37
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 NECTIN2Q92692 538 aa17.36■□□□□ 0.37
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 MTFR1LQ9H019 292 aa17.36■□□□□ 0.37
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TSPYL6Q8N831 410 aa17.35■□□□□ 0.37
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 NUP98P52948 1817 aa17.35■□□□□ 0.37
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 HOXB7P09629 217 aa17.34■□□□□ 0.37
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 RFC4P35249 363 aa17.34■□□□□ 0.37
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PROSER3Q2NL68 480 aa17.34■□□□□ 0.37
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SLC16A10Q8TF71 515 aa17.34■□□□□ 0.37
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CACNA1FO60840 1977 aa17.33■□□□□ 0.37
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ANXA1P04083 346 aa17.33■□□□□ 0.36
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PTGER2P43116 358 aa17.33■□□□□ 0.36
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 GOLGA2Q08379 1002 aa17.33■□□□□ 0.36
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa17.33■□□□□ 0.36
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CDCA7LQ96GN5 454 aa17.33■□□□□ 0.36
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 MYH16Q9H6N6 1097 aa17.33■□□□□ 0.36
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ERBB4Q15303 1308 aa17.32■□□□□ 0.36
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 GYS1P13807 737 aa17.32■□□□□ 0.36
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 MYL6BP14649 208 aa17.32■□□□□ 0.36
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PDIA6Q15084 440 aa17.32■□□□□ 0.36
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SGIP1Q9BQI5 828 aa17.32■□□□□ 0.36
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SPON1Q9HCB6 807 aa17.32■□□□□ 0.36
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa17.32■□□□□ 0.36
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 USPL1Q5W0Q7 1092 aa17.31■□□□□ 0.36
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 LRP10Q7Z4F1 713 aa17.31■□□□□ 0.36
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CHPF2Q9P2E5 772 aa17.31■□□□□ 0.36
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 NARFQ9UHQ1 456 aa17.31■□□□□ 0.36
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa17.31■□□□□ 0.36
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa17.3■□□□□ 0.36
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 A0A087WZG4 1122 aa17.3■□□□□ 0.36
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 E9PSI1 815 aa17.3■□□□□ 0.36
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SLFN5Q08AF3 891 aa17.3■□□□□ 0.36
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 BCL2L12Q9HB09 334 aa17.3■□□□□ 0.36
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ZPR1O75312 459 aa17.29■□□□□ 0.36
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CAMTA2O94983 1202 aa17.29■□□□□ 0.36
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 FKBP8Q14318 412 aa17.29■□□□□ 0.36
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TTLL7Q6ZT98 887 aa17.28■□□□□ 0.36
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ARXQ96QS3 562 aa17.28■□□□□ 0.36
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP17.28■□□□□ 0.36
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 NRXN2Q9P2S2 1712 aa17.27■□□□□ 0.36
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ZBED9Q6R2W3 1325 aa17.27■□□□□ 0.36
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 KIF13BQ9NQT8 1826 aa17.27■□□□□ 0.36
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 MMP10P09238 476 aa17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.1 ms