RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513069.1

SH3BP2-225, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 866 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SH3BP2-225ENST00000513069 USP16Q9Y5T5 823 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-225ENST00000513069 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
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SH3BP2-225ENST00000513069 SERPINB2P05120 415 aa19.76■□□□□ 0.75
SH3BP2-225ENST00000513069 CLEC4GQ6UXB4 293 aa19.76■□□□□ 0.75
SH3BP2-225ENST00000513069 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
SH3BP2-225ENST00000513069 UTRNP46939 3433 aa19.76■□□□□ 0.75
SH3BP2-225ENST00000513069 RGL2O15211 777 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP2-225ENST00000513069 WDR63Q8IWG1 891 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP2-225ENST00000513069 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
SH3BP2-225ENST00000513069 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
SH3BP2-225ENST00000513069 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP19.74■□□□□ 0.75
SH3BP2-225ENST00000513069 TGFB2P61812 414 aa19.74■□□□□ 0.75
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