RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493831.1

ETV1-222, Transcript of ETS variant 1, human

TSL 2

Gene ETV1, Length 536 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ETV1-222	ENST00000493831	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
ETV1-222	ENST00000493831	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ETV1-222	ENST00000493831	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
ETV1-222	ENST00000493831	FURIN	P09958	794 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ETV1-222	ENST00000493831	BMP4	P12644	408 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ETV1-222	ENST00000493831	CENPC	Q03188	943 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ETV1-222	ENST00000493831	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ETV1-222	ENST00000493831	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ETV1-222	ENST00000493831	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ETV1-222	ENST00000493831		Q8N3U1	123 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ETV1-222	ENST00000493831	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
ETV1-222	ENST00000493831	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ETV1-222	ENST00000493831	NOD1	Q9Y239	953 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ETV1-222	ENST00000493831	GNB5	O14775	395 aa		5.87	□□□□□ -1.47
ETV1-222	ENST00000493831	GTF2I	P78347	998 aa		5.87	□□□□□ -1.47
ETV1-222	ENST00000493831	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		5.87	□□□□□ -1.47
ETV1-222	ENST00000493831	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
ETV1-222	ENST00000493831	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		5.87	□□□□□ -1.47
ETV1-222	ENST00000493831	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	5.87	□□□□□ -1.47
ETV1-222	ENST00000493831	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		5.86	□□□□□ -1.47
ETV1-222	ENST00000493831	INHA	P05111	366 aa		5.86	□□□□□ -1.47
ETV1-222	ENST00000493831	PHKA2	P46019	1235 aa		5.86	□□□□□ -1.47
ETV1-222	ENST00000493831	GDF10	P55107	478 aa		5.86	□□□□□ -1.47
ETV1-222	ENST00000493831	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	5.86	□□□□□ -1.47
ETV1-222	ENST00000493831	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
ETV1-222	ENST00000493831	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
ETV1-222	ENST00000493831	COL8A1	P27658	744 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ETV1-222	ENST00000493831	CLDN10	P78369	228 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ETV1-222	ENST00000493831	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ETV1-222	ENST00000493831	C14orf37	Q86TY3	774 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ETV1-222	ENST00000493831	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ETV1-222	ENST00000493831	GGA1	Q9UJY5	639 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ETV1-222	ENST00000493831	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ETV1-222	ENST00000493831	CUX2	O14529	1486 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ETV1-222	ENST00000493831	ARID3C	A6NKF2	412 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ETV1-222	ENST00000493831	FGFR3	P22607	806 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ETV1-222	ENST00000493831	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
ETV1-222	ENST00000493831	PSME1	Q06323	249 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ETV1-222	ENST00000493831	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ETV1-222	ENST00000493831	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
ETV1-222	ENST00000493831	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
ETV1-222	ENST00000493831	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	5.84	□□□□□ -1.47
ETV1-222	ENST00000493831	RUBCNL	Q9H714	662 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ETV1-222	ENST00000493831	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	THBS1	P07996	1170 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	ARAF	P10398	606 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	EPX	P11678	715 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	MSX1	P28360	303 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	TLR1	Q15399	786 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	TRIM50	Q86XT4	487 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	OGFOD1	Q8N543	542 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	ZNF358	Q9NW07	568 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	SMTN	P53814	917 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	C4orf17	Q53FE4	359 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	CCDC102B	Q68D86	513 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	ILDR2	Q71H61	639 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	BTBD6	Q96KE9	485 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	USP3	Q9Y6I4	520 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831		A6NJY4	79 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	DKK1	O94907	266 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	RASA1	P20936	1047 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	RFX1	P22670	979 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	ATP1A2	P50993	1020 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	BACH1	O14867	736 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	BNIP3L	O60238	219 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	ADH6	P28332	368 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	DGKG	P49619	791 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	CTBS	Q01459	385 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	MTFR1	Q15390	333 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	CDCA8	Q53HL2	280 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	CD163	Q86VB7	1156 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	TNS4	Q8IZW8	715 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	SIX5	Q8N196	739 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	SFI1	A8K8P3	1242 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	CDK2AP1	O14519	115 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	C2CD2L	O14523	706 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	EPHA4	P54764	986 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	PTK7	Q13308	1070 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ETV1-222	ENST00000493831	NLRP8	Q86W28	1048 aa		5.79	□□□□□ -1.48

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