RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
ACTB-211ENST00000480301 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa27.59■■■□□ 2.01
ACTB-211ENST00000480301 LMOD3Q0VAK6 560 aa27.58■■■□□ 2.01
ACTB-211ENST00000480301 RFC4P35249 363 aa27.57■■■□□ 2
ACTB-211ENST00000480301 SYT17Q9BSW7 474 aa27.57■■■□□ 2
ACTB-211ENST00000480301 TRIM35Q9UPQ4 493 aa27.57■■■□□ 2
ACTB-211ENST00000480301 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
ACTB-211ENST00000480301 MRS2Q9HD23 443 aa27.56■■■□□ 2
ACTB-211ENST00000480301 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa27.55■■■□□ 2
ACTB-211ENST00000480301 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
ACTB-211ENST00000480301 USP16Q9Y5T5 823 aa27.55■■■□□ 2
ACTB-211ENST00000480301 GYS1P13807 737 aa27.54■■■□□ 2
ACTB-211ENST00000480301 CANXP27824 592 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
ACTB-211ENST00000480301 APAF1O14727 1248 aa27.53■■■□□ 2
ACTB-211ENST00000480301 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
ACTB-211ENST00000480301 A1BGP04217 495 aa27.52■■■□□ 2
ACTB-211ENST00000480301 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
ACTB-211ENST00000480301 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
ACTB-211ENST00000480301 EIF5P55010 431 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
ACTB-211ENST00000480301 NLGN1Q8N2Q7 840 aa27.51■■□□□ 1.99
ACTB-211ENST00000480301 KDM3BQ7LBC6 1761 aa27.5■■□□□ 1.99
ACTB-211ENST00000480301 COL15A1P39059 1388 aa27.49■■□□□ 1.99
ACTB-211ENST00000480301 BABAM1Q9NWV8 329 aa27.49■■□□□ 1.99
ACTB-211ENST00000480301 TSPYL4Q9UJ04 414 aa27.49■■□□□ 1.99
ACTB-211ENST00000480301 C4AP0C0L4 1744 aa27.49■■□□□ 1.99
ACTB-211ENST00000480301 KLHL34Q8N239 644 aa27.48■■□□□ 1.99
ACTB-211ENST00000480301 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
ACTB-211ENST00000480301 MMP10P09238 476 aa27.47■■□□□ 1.99
ACTB-211ENST00000480301 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
ACTB-211ENST00000480301 NARFQ9UHQ1 456 aa27.47■■□□□ 1.99
ACTB-211ENST00000480301 ZPR1O75312 459 aa27.46■■□□□ 1.99
ACTB-211ENST00000480301 FKBP8Q14318 412 aa27.46■■□□□ 1.99
ACTB-211ENST00000480301 USPL1Q5W0Q7 1092 aa27.46■■□□□ 1.99
ACTB-211ENST00000480301 A0A087WZG4 1122 aa27.44■■□□□ 1.98
ACTB-211ENST00000480301 CHL1O00533 1208 aa27.44■■□□□ 1.98
ACTB-211ENST00000480301 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
ACTB-211ENST00000480301 BCL2L12Q9HB09 334 aa27.44■■□□□ 1.98
ACTB-211ENST00000480301 NLGN2Q8NFZ4 835 aa27.43■■□□□ 1.98
ACTB-211ENST00000480301 CD2APQ9Y5K6 639 aa27.43■■□□□ 1.98
ACTB-211ENST00000480301 NBPF26B4DH59 902 aa27.42■■□□□ 1.98
ACTB-211ENST00000480301 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
ACTB-211ENST00000480301 NBPF15Q8N660 670 aa27.42■■□□□ 1.98
ACTB-211ENST00000480301 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
ACTB-211ENST00000480301 TM4SF1P30408 202 aa27.4■■□□□ 1.98
ACTB-211ENST00000480301 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa27.4■■□□□ 1.98
ACTB-211ENST00000480301 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
ACTB-211ENST00000480301 PARP3Q9Y6F1 533 aa27.39■■□□□ 1.98
ACTB-211ENST00000480301 DDR1Q08345 913 aa27.38■■□□□ 1.97
ACTB-211ENST00000480301 CFAP44Q96MT7 982 aa27.38■■□□□ 1.97
ACTB-211ENST00000480301 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa27.37■■□□□ 1.97
ACTB-211ENST00000480301 ZNF853P0CG23 659 aa27.37■■□□□ 1.97
ACTB-211ENST00000480301 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
ACTB-211ENST00000480301 FAM9BQ8IZU0 186 aa27.36■■□□□ 1.97
ACTB-211ENST00000480301 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
ACTB-211ENST00000480301 CAMTA2O94983 1202 aa27.35■■□□□ 1.97
ACTB-211ENST00000480301 NFIXQ14938 502 aa27.35■■□□□ 1.97
ACTB-211ENST00000480301 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
ACTB-211ENST00000480301 DCAF8L1A6NGE4 600 aa27.34■■□□□ 1.97
ACTB-211ENST00000480301 CCDC27Q2M243 656 aa27.34■■□□□ 1.97
ACTB-211ENST00000480301 KRT24Q2M2I5 525 aa27.34■■□□□ 1.97
ACTB-211ENST00000480301 IFT57Q9NWB7 429 aa27.34■■□□□ 1.97
ACTB-211ENST00000480301 LAMB4A4D0S4 1761 aa27.34■■□□□ 1.97
ACTB-211ENST00000480301 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
ACTB-211ENST00000480301 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
ACTB-211ENST00000480301 MBIPQ9NS73 344 aa27.33■■□□□ 1.97
ACTB-211ENST00000480301 GNAI1P63096 354 aa27.31■■□□□ 1.96
ACTB-211ENST00000480301 WWC1Q8IX03 1113 aa27.31■■□□□ 1.96
ACTB-211ENST00000480301 C10orf71Q711Q0 1435 aa27.31■■□□□ 1.96
ACTB-211ENST00000480301 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
ACTB-211ENST00000480301 TBC1D9BQ66K14 1250 aa27.3■■□□□ 1.96
ACTB-211ENST00000480301 ERBB4Q15303 1308 aa27.3■■□□□ 1.96
ACTB-211ENST00000480301 PDIA6Q15084 440 aa27.29■■□□□ 1.96
ACTB-211ENST00000480301 BICDL1Q6ZP65 573 aa27.29■■□□□ 1.96
ACTB-211ENST00000480301 SCN7AQ01118 1682 aa27.27■■□□□ 1.96
ACTB-211ENST00000480301 SERPINB2P05120 415 aa27.27■■□□□ 1.96
ACTB-211ENST00000480301 MYL6BP14649 208 aa27.27■■□□□ 1.96
ACTB-211ENST00000480301 TGFB2P61812 414 aa27.27■■□□□ 1.96
ACTB-211ENST00000480301 GPR162Q16538 588 aa27.27■■□□□ 1.96
ACTB-211ENST00000480301 NGEFQ8N5V2 710 aa27.27■■□□□ 1.96
ACTB-211ENST00000480301 CLEC4GQ6UXB4 293 aa27.26■■□□□ 1.95
ACTB-211ENST00000480301 LRP10Q7Z4F1 713 aa27.26■■□□□ 1.95
ACTB-211ENST00000480301 KIF13BQ9NQT8 1826 aa27.25■■□□□ 1.95
ACTB-211ENST00000480301 RGL2O15211 777 aa27.25■■□□□ 1.95
ACTB-211ENST00000480301 HOXB7P09629 217 aa27.25■■□□□ 1.95
ACTB-211ENST00000480301 TTLL7Q6ZT98 887 aa27.25■■□□□ 1.95
ACTB-211ENST00000480301 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
ACTB-211ENST00000480301 NECTIN2Q92692 538 aa27.25■■□□□ 1.95
ACTB-211ENST00000480301 PROSER3Q2NL68 480 aa27.24■■□□□ 1.95
ACTB-211ENST00000480301 DUSP27Q5VZP5 1158 aa27.24■■□□□ 1.95
ACTB-211ENST00000480301 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
ACTB-211ENST00000480301 PXDNLA1KZ92 1463 aa27.24■■□□□ 1.95
ACTB-211ENST00000480301 BCORQ6W2J9 1755 aa27.23■■□□□ 1.95
ACTB-211ENST00000480301 CCER2I3L3R5 266 aa27.23■■□□□ 1.95
ACTB-211ENST00000480301 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP27.23■■□□□ 1.954e-79■□□□□ 9.7
ACTB-211ENST00000480301 HLFQ16534 295 aa27.23■■□□□ 1.95
ACTB-211ENST00000480301 A0A0G2JLW4 131 aa27.22■■□□□ 1.95
ACTB-211ENST00000480301 ANXA1P04083 346 aa27.22■■□□□ 1.95
ACTB-211ENST00000480301 SETDB2Q96T68 719 aa27.22■■□□□ 1.95
ACTB-211ENST00000480301 ZNF652Q9Y2D9 606 aa27.22■■□□□ 1.95
ACTB-211ENST00000480301 DPEP1P16444 411 aa27.21■■□□□ 1.95
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