RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428482.5

HDLBP-216, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 5

Gene HDLBP, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-216	ENST00000428482	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
HDLBP-216	ENST00000428482	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HDLBP-216	ENST00000428482	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HDLBP-216	ENST00000428482	GYS1	P13807	737 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HDLBP-216	ENST00000428482	NFE2L2	Q16236	605 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HDLBP-216	ENST00000428482	ZNF790	Q6PG37	636 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HDLBP-216	ENST00000428482	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
HDLBP-216	ENST00000428482	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
HDLBP-216	ENST00000428482	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HDLBP-216	ENST00000428482	DDR1	Q08345	913 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HDLBP-216	ENST00000428482	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HDLBP-216	ENST00000428482	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HDLBP-216	ENST00000428482	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HDLBP-216	ENST00000428482	BTBD11	A6QL63	1104 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HDLBP-216	ENST00000428482	RPS6KA4	O75676	772 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HDLBP-216	ENST00000428482	MMP10	P09238	476 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HDLBP-216	ENST00000428482	FKBP8	Q14318	412 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HDLBP-216	ENST00000428482	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HDLBP-216	ENST00000428482	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HDLBP-216	ENST00000428482	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	13.58	□□□□□ -0.24	5e-10	■■■■□ 24.3
HDLBP-216	ENST00000428482	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
HDLBP-216	ENST00000428482	NUP98	P52948	1817 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDLBP-216	ENST00000428482	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
HDLBP-216	ENST00000428482	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
HDLBP-216	ENST00000428482	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDLBP-216	ENST00000428482	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDLBP-216	ENST00000428482	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDLBP-216	ENST00000428482	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDLBP-216	ENST00000428482	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDLBP-216	ENST00000428482	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
HDLBP-216	ENST00000428482	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
HDLBP-216	ENST00000428482	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
HDLBP-216	ENST00000428482	A1BG	P04217	495 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDLBP-216	ENST00000428482	ADRA2B	P18089	450 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDLBP-216	ENST00000428482	RFC4	P35249	363 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDLBP-216	ENST00000428482	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDLBP-216	ENST00000428482	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDLBP-216	ENST00000428482	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
HDLBP-216	ENST00000428482	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24
HDLBP-216	ENST00000428482	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDLBP-216	ENST00000428482	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDLBP-216	ENST00000428482	USP16	Q9Y5T5	823 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDLBP-216	ENST00000428482	NEUROD2	Q15784	382 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HDLBP-216	ENST00000428482	KRT24	Q2M2I5	525 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HDLBP-216	ENST00000428482	LAMB2	P55268	1798 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HDLBP-216	ENST00000428482	NBPF26	B4DH59	902 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482	RIPK4	P57078	832 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482	NBPF15	Q8N660	670 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482	NFIX	Q14938	502 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482	CAMTA2	O94983	1202 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482	NARF	Q9UHQ1	456 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482	NEFM	P07197	916 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482	RUNDC1	Q96C34	613 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482	ABCC12	Q96J65	1359 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482	ANXA1	P04083	346 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482	YY1	P25490	414 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482	GPR162	Q16538	588 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482	PROSER3	Q2NL68	480 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482	SBF1	O95248	1867 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482	APAF1	O14727	1248 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482	ZPR1	O75312	459 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482	STARD3NL	O95772	234 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482	DPEP1	P16444	411 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482	CHRNA5	P30532	468 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482	COL4A1	P02462	1669 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482	ADCY9	O60503	1353 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482	SLX4	Q8IY92	1834 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482		A0A0G2JLW4	131 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482	TM4SF1	P30408	202 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482	NECTIN2	Q92692	538 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482	MRS2	Q9HD23	443 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HDLBP-216	ENST00000428482	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HDLBP-216	ENST00000428482	SLC51A	Q86UW1	340 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HDLBP-216	ENST00000428482	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HDLBP-216	ENST00000428482	KCNA3	P22001	575 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HDLBP-216	ENST00000428482	HLF	Q16534	295 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HDLBP-216	ENST00000428482	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HDLBP-216	ENST00000428482	NGEF	Q8N5V2	710 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HDLBP-216	ENST00000428482	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26

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