RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412165.1

USP9YP19-201, Transcript of USP9Y pseudogene 19, humanhuman

BASIC

Gene USP9YP19, Length 485 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YP19-201ENST00000412165 H7C1W4 665 aa11.48□□□□□ -0.57
USP9YP19-201ENST00000412165 LGR5O75473 907 aa11.48□□□□□ -0.57
USP9YP19-201ENST00000412165 F11P03951 625 aa11.48□□□□□ -0.57
USP9YP19-201ENST00000412165 ARXQ96QS3 562 aa11.48□□□□□ -0.57
USP9YP19-201ENST00000412165 PARP3Q9Y6F1 533 aa11.48□□□□□ -0.57
USP9YP19-201ENST00000412165 ATAD2Q6PL18 1390 aa11.48□□□□□ -0.57
USP9YP19-201ENST00000412165 ITGA6P23229 1130 aa11.47□□□□□ -0.57
USP9YP19-201ENST00000412165 EPHA4P54764 986 aa11.47□□□□□ -0.57
USP9YP19-201ENST00000412165 SWI5Q1ZZU3 235 aa11.47□□□□□ -0.57
USP9YP19-201ENST00000412165 GAS2L2Q8NHY3 880 aa11.47□□□□□ -0.57
USP9YP19-201ENST00000412165 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
USP9YP19-201ENST00000412165 USP3Q9Y6I4 520 aa11.47□□□□□ -0.57
USP9YP19-201ENST00000412165 NOS2P35228 1153 aa11.46□□□□□ -0.57
USP9YP19-201ENST00000412165 FOXK2Q01167 660 aa11.46□□□□□ -0.57
USP9YP19-201ENST00000412165 TEAD4Q15561 434 aa11.46□□□□□ -0.57
USP9YP19-201ENST00000412165 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
USP9YP19-201ENST00000412165 FOXR1Q6PIV2 292 aa11.46□□□□□ -0.57
USP9YP19-201ENST00000412165 BICDL1Q6ZP65 573 aa11.46□□□□□ -0.57
USP9YP19-201ENST00000412165 STK32AQ8WU08 396 aa11.46□□□□□ -0.57
USP9YP19-201ENST00000412165 L3MBTL2Q969R5 705 aa11.46□□□□□ -0.57
USP9YP19-201ENST00000412165 NEUROD4Q9HD90 331 aa11.46□□□□□ -0.57
USP9YP19-201ENST00000412165 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa11.46□□□□□ -0.57
USP9YP19-201ENST00000412165 GJA3Q9Y6H8 435 aa11.46□□□□□ -0.57
USP9YP19-201ENST00000412165 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa11.45□□□□□ -0.58
USP9YP19-201ENST00000412165 WFS1O76024 890 aa11.45□□□□□ -0.58
USP9YP19-201ENST00000412165 EFHC2Q5JST6 749 aa11.45□□□□□ -0.58
USP9YP19-201ENST00000412165 SV2AQ7L0J3 742 aa11.45□□□□□ -0.58
USP9YP19-201ENST00000412165 C1orf216Q8TAB5 229 aa11.45□□□□□ -0.58
USP9YP19-201ENST00000412165 IRF7Q92985 503 aa11.45□□□□□ -0.58
USP9YP19-201ENST00000412165 H3BM21 787 aa11.44□□□□□ -0.58
USP9YP19-201ENST00000412165 MSX1P28360 303 aa11.44□□□□□ -0.58
USP9YP19-201ENST00000412165 TMEM164Q5U3C3 297 aa11.44□□□□□ -0.58
USP9YP19-201ENST00000412165 GMCL1Q96IK5 515 aa11.43□□□□□ -0.58
USP9YP19-201ENST00000412165 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP11.43□□□□□ -0.58
USP9YP19-201ENST00000412165 IGFBP4P22692 258 aa11.42□□□□□ -0.58
USP9YP19-201ENST00000412165 VWA5B2Q8N398 1253 aa11.42□□□□□ -0.58
USP9YP19-201ENST00000412165 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
USP9YP19-201ENST00000412165 RUBCNLQ9H714 662 aa11.42□□□□□ -0.58
USP9YP19-201ENST00000412165 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa11.42□□□□□ -0.58
USP9YP19-201ENST00000412165 PRMT3O60678 531 aa11.41□□□□□ -0.58
USP9YP19-201ENST00000412165 TRIM22Q8IYM9 498 aa11.41□□□□□ -0.58
USP9YP19-201ENST00000412165 NGLY1Q96IV0 654 aa11.41□□□□□ -0.58
USP9YP19-201ENST00000412165 PRIMPOLQ96LW4 560 aa11.41□□□□□ -0.58
USP9YP19-201ENST00000412165 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa11.41□□□□□ -0.58
USP9YP19-201ENST00000412165 TRERF1Q96PN7 1200 aa11.4□□□□□ -0.58
USP9YP19-201ENST00000412165 PDE4CQ08493 712 aa11.39□□□□□ -0.59
USP9YP19-201ENST00000412165 RHPN1Q8TCX5 695 aa11.39□□□□□ -0.59
USP9YP19-201ENST00000412165 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa11.39□□□□□ -0.59
USP9YP19-201ENST00000412165 EML1O00423 815 aa11.38□□□□□ -0.59
USP9YP19-201ENST00000412165 FOXO3O43524 673 aa11.38□□□□□ -0.59
USP9YP19-201ENST00000412165 TXLNAP40222 546 aa11.38□□□□□ -0.59
USP9YP19-201ENST00000412165 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
USP9YP19-201ENST00000412165 TREML4Q6UXN2 200 aa11.38□□□□□ -0.59
USP9YP19-201ENST00000412165 STAG2Q8N3U4 1231 aa11.38□□□□□ -0.59
USP9YP19-201ENST00000412165 C21orf2O43822 256 aa11.37□□□□□ -0.59
USP9YP19-201ENST00000412165 LBRQ14739 615 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
USP9YP19-201ENST00000412165 DBN1Q16643 649 aa11.37□□□□□ -0.59
USP9YP19-201ENST00000412165 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
USP9YP19-201ENST00000412165 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
USP9YP19-201ENST00000412165 PHACTR1Q9C0D0 580 aa11.37□□□□□ -0.59
USP9YP19-201ENST00000412165 WEE1P30291 646 aa11.36□□□□□ -0.59
USP9YP19-201ENST00000412165 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa11.36□□□□□ -0.59
USP9YP19-201ENST00000412165 FIGNL1Q6PIW4 674 aa11.36□□□□□ -0.59
USP9YP19-201ENST00000412165 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa11.36□□□□□ -0.59
USP9YP19-201ENST00000412165 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
USP9YP19-201ENST00000412165 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
USP9YP19-201ENST00000412165 PHF24Q9UPV7 400 aa11.36□□□□□ -0.59
USP9YP19-201ENST00000412165 A0A1W2PNR3 127 aa11.35□□□□□ -0.59
USP9YP19-201ENST00000412165 C1orf53Q5VUE5 145 aa11.35□□□□□ -0.59
USP9YP19-201ENST00000412165 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa11.35□□□□□ -0.59
USP9YP19-201ENST00000412165 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
USP9YP19-201ENST00000412165 CRISPLD1Q9H336 500 aa11.35□□□□□ -0.59
USP9YP19-201ENST00000412165 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
USP9YP19-201ENST00000412165 ATP4AP20648 1035 aa11.34□□□□□ -0.59
USP9YP19-201ENST00000412165 ATP2B4P23634 1241 aa11.34□□□□□ -0.59
USP9YP19-201ENST00000412165 FAM69CQ0P6D2 419 aa11.34□□□□□ -0.59
USP9YP19-201ENST00000412165 HIF1AQ16665 826 aa11.34□□□□□ -0.59
USP9YP19-201ENST00000412165 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa11.34□□□□□ -0.59
USP9YP19-201ENST00000412165 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
USP9YP19-201ENST00000412165 NLRP8Q86W28 1048 aa11.33□□□□□ -0.6
USP9YP19-201ENST00000412165 USTQ9Y2C2 406 aa11.33□□□□□ -0.6
USP9YP19-201ENST00000412165 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
USP9YP19-201ENST00000412165 ZIC5Q96T25 663 aa11.32□□□□□ -0.6
USP9YP19-201ENST00000412165 MKNK1Q9BUB5 465 aa11.32□□□□□ -0.6
USP9YP19-201ENST00000412165 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
USP9YP19-201ENST00000412165 ERBB4Q15303 1308 aa11.32□□□□□ -0.6
USP9YP19-201ENST00000412165 GPR25O00155 361 aa11.31□□□□□ -0.6
USP9YP19-201ENST00000412165 VSIG8P0DPA2 414 aa11.31□□□□□ -0.6
USP9YP19-201ENST00000412165 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa11.31□□□□□ -0.6
USP9YP19-201ENST00000412165 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa11.31□□□□□ -0.6
USP9YP19-201ENST00000412165 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
USP9YP19-201ENST00000412165 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
USP9YP19-201ENST00000412165 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
USP9YP19-201ENST00000412165 RTN1Q16799 776 aa11.29□□□□□ -0.6
USP9YP19-201ENST00000412165 RETREG2Q8NC44 543 aa11.29□□□□□ -0.6
USP9YP19-201ENST00000412165 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
USP9YP19-201ENST00000412165 MTMR7Q9Y216 660 aa11.29□□□□□ -0.6
USP9YP19-201ENST00000412165 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa11.29□□□□□ -0.6
USP9YP19-201ENST00000412165 TMEM88BA6NKF7 163 aa11.28□□□□□ -0.6
USP9YP19-201ENST00000412165 GMPRP36959 345 aa11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.9 ms