RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000188967.1

Nanog-ps1-201, mousemouse

BASIC

Gene Nanog-ps1, Length 250 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Spire2Q8K1S6 718 aa11.75□□□□□ -0.53
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Upf1Q9EPU0 1124 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Rapgef4Q9EQZ6 1011 aa11.75□□□□□ -0.53
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Prdm11A2AGX3 565 aa11.74□□□□□ -0.53
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Prr5lA2AVJ5 370 aa11.74□□□□□ -0.53
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Atf5O70191 283 aa11.74□□□□□ -0.53
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 PgfP49764 158 aa11.74□□□□□ -0.53
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 VwdeQ6DFV8 926 aa11.74□□□□□ -0.53
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Znf428Q8C1M2 176 aa11.74□□□□□ -0.53
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Mylk2Q8VCR8 613 aa11.74□□□□□ -0.53
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Cd248Q91V98 765 aa11.74□□□□□ -0.53
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Zfp646Q6NV66 1788 aa11.74□□□□□ -0.53
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Cnnm1Q0GA42 951 aa11.73□□□□□ -0.53
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Iqcf3Q9D498 203 aa11.73□□□□□ -0.53
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 GsdmaQ9EST1 446 aa11.73□□□□□ -0.53
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Dpf1Q9QX66 387 aa11.73□□□□□ -0.53
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Gja3Q64448 417 aa11.72□□□□□ -0.53
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Pdzph1Q8BGR1 1238 aa11.72□□□□□ -0.53
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Dlg5E9Q9R9 1921 aa11.71□□□□□ -0.53
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 D830030K20RikE9PYQ5 218 aa11.71□□□□□ -0.53
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Gm3043K7N693 218 aa11.71□□□□□ -0.53
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Gm16440K7N6G6 218 aa11.71□□□□□ -0.53
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Gm2244L7N2A3 218 aa11.71□□□□□ -0.53
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Gm3278L7N2D2 218 aa11.71□□□□□ -0.53
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Gm8271L7N2E2 218 aa11.71□□□□□ -0.53
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Snai1Q02085 264 aa11.71□□□□□ -0.53
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Arid3aQ62431 601 aa11.71□□□□□ -0.53
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Esco1Q69Z69 843 aa11.71□□□□□ -0.53
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Slf2Q6P9P0 1278 aa11.71□□□□□ -0.53
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Gigyf1Q99MR1 1044 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa11.71□□□□□ -0.53
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Ambra1A2AH22 1300 aa11.7□□□□□ -0.54
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 CfhP06909 1234 aa11.7□□□□□ -0.54
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 SobpQ0P5V2 864 aa11.7□□□□□ -0.54
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Q4VA45 678 aa11.7□□□□□ -0.54
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Stxbp5lQ5DQR4 1185 aa11.7□□□□□ -0.54
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Prkab2Q6PAM0 271 aa11.7□□□□□ -0.54
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Unc5clQ6R653 518 aa11.7□□□□□ -0.54
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Ptcd1Q8C2E4 695 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Flad1Q8R123 492 aa11.7□□□□□ -0.54
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 TefQ9JLC6 301 aa11.7□□□□□ -0.54
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Tspoap1Q7TNF8 1846 aa11.7□□□□□ -0.54
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Prim1P20664 417 aa11.69□□□□□ -0.54
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Bcl2l13P59017 434 aa11.69□□□□□ -0.54
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Slc39a6Q8C145 765 aa11.69□□□□□ -0.54
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Iqsec3Q3TES0 1195 aa11.68□□□□□ -0.54
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Ggnbp2Q5SV77 696 aa11.68□□□□□ -0.54
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Stk32bQ9JJX8 414 aa11.68□□□□□ -0.54
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Trpm7Q923J1 1863 aa11.68□□□□□ -0.54
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Ifit1bl2Q3U687 466 aa11.67□□□□□ -0.54
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 St5Q924W7 1134 aa11.67□□□□□ -0.54
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 NgdnQ9DB96 315 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Senp3Q9EP97 568 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Sipa1l3G3X9J0 1776 aa11.67□□□□□ -0.54
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Usp19Q3UJD6 1360 aa11.67□□□□□ -0.54
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Col5a2Q3U962 1497 aa11.66□□□□□ -0.54
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Cyp2c23E9Q5K4 494 aa11.66□□□□□ -0.54
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Apaf1O88879 1249 aa11.66□□□□□ -0.54
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Rbm46P86049 533 aa11.66□□□□□ -0.54
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Setdb1O88974 1307 aa11.65□□□□□ -0.54
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Tnnt1O88346 262 aa11.65□□□□□ -0.54
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 SowahdQ8BY98 327 aa11.65□□□□□ -0.54
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Pdia6Q922R8 440 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Ppp1r3fQ9JIG4 799 aa11.65□□□□□ -0.54
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Usp34Q6ZQ93 3582 aa11.65□□□□□ -0.54
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Btaf1E9QAE3 1848 aa11.65□□□□□ -0.55
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Nup188Q6ZQH8 1759 aa11.64□□□□□ -0.55
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Prr29B1ARI9 187 aa11.64□□□□□ -0.55
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Pde4bB1AWC9 736 aa11.64□□□□□ -0.55
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Stox1B2RQL2 990 aa11.64□□□□□ -0.55
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Olfr247E9PVJ7 320 aa11.64□□□□□ -0.55
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 NpcdF8VQB8 469 aa11.64□□□□□ -0.55
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Olfr819K7N727 320 aa11.64□□□□□ -0.55
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 CltaO08585 235 aa11.64□□□□□ -0.55
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Dusp27Q148W8 1138 aa11.64□□□□□ -0.55
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Fhdc1Q3ULZ2 1149 aa11.64□□□□□ -0.55
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Adam1aQ60813 791 aa11.64□□□□□ -0.55
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Dbndd1Q9CZ00 160 aa11.64□□□□□ -0.55
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Ptf1aQ9QX98 324 aa11.64□□□□□ -0.55
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Scn9aQ62205 1984 aa11.64□□□□□ -0.55
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Mrc1Q61830 1456 aa11.63□□□□□ -0.55
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa11.63□□□□□ -0.55
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Cers3Q1A3B0 383 aa11.63□□□□□ -0.55
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 PdgfdQ925I7 370 aa11.63□□□□□ -0.55
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Mapk8ip1Q9WVI9 707 aa11.63□□□□□ -0.55
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Zfp831A2ADM8 1628 aa11.63□□□□□ -0.55
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Col1a2Q01149 1372 aa11.63□□□□□ -0.55
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Duox1A2AQ92 1551 aa11.62□□□□□ -0.55
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Ankrd31A0A140LI88 1765 aa11.62□□□□□ -0.55
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Pibf1E9Q6K3 756 aa11.62□□□□□ -0.55
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Dctn1O08788 1281 aa11.62□□□□□ -0.55
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Fkbp4P30416 458 aa11.62□□□□□ -0.55
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 CastP51125 788 aa11.62□□□□□ -0.55
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Eif4a1P60843 406 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Dok7Q18PE0 504 aa11.62□□□□□ -0.55
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Usp48Q3V0C5 1052 aa11.62□□□□□ -0.55
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Q7TT23 1179 aa11.62□□□□□ -0.55
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Rbm5Q91YE7 815 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 76.5 ms