RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000079702.3

Cbx1-202, Transcript of Chromobox protein homolog 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Cbx1, Length 912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Col4a1P02463 1669 aa15.73■□□□□ 0.11
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Pibf1E9Q6K3 756 aa15.72■□□□□ 0.11
Cbx1-202ENSMUST00000079702 CastP51125 788 aa15.72■□□□□ 0.11
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rad23bP54728 416 aa15.72■□□□□ 0.11
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tlr8P58682 1032 aa15.72■□□□□ 0.11
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Srp68Q8BMA6 625 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ppm1fQ8CGA0 452 aa15.72■□□□□ 0.11
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Erbb4Q61527 1308 aa15.71■□□□□ 0.11
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Prr5lA2AVJ5 370 aa15.71■□□□□ 0.11
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tnnt1O88346 262 aa15.71■□□□□ 0.11
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Zbtb7aO88939 569 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Magea6O89010 325 aa15.71■□□□□ 0.11
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Fkbp4P30416 458 aa15.71■□□□□ 0.11
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Chpf2Q3UU43 768 aa15.71■□□□□ 0.11
Cbx1-202ENSMUST00000079702 1810065E05RikQ5NC41 235 aa15.71■□□□□ 0.11
Cbx1-202ENSMUST00000079702 U2surpQ6NV83 1029 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Magea3Q6T340 320 aa15.71■□□□□ 0.11
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
Cbx1-202ENSMUST00000079702 CrbnQ8C7D2 445 aa15.71■□□□□ 0.11
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tmem119Q8R138 280 aa15.71■□□□□ 0.11
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Nsfl1cQ9CZ44 370 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cdc37l1Q9CZP7 335 aa15.71■□□□□ 0.11
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Trip6Q9Z1Y4 480 aa15.71■□□□□ 0.11
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ubn2Q80WC1 1314 aa15.7■□□□□ 0.1
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Bcl2l13P59017 434 aa15.7■□□□□ 0.1
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rbm26Q6NZN0 1012 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ddx60E9PZQ1 1711 aa15.69■□□□□ 0.1
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Dlg5E9Q9R9 1921 aa15.69■□□□□ 0.1
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Mrps5Q99N87 432 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Atxn3Q9CVD2 355 aa15.69■□□□□ 0.1
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Usp21Q9QZL6 566 aa15.69■□□□□ 0.1
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Togaram1Q6A070 1776 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
Cbx1-202ENSMUST00000079702 1700019A02RikA0A087WPV9 146 aa15.68■□□□□ 0.1
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Strn4P58404 760 aa15.68■□□□□ 0.1
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Q3TQI7 289 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
Cbx1-202ENSMUST00000079702 PsapQ61207 557 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ralbp1Q62172 648 aa15.68■□□□□ 0.1
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Slc39a6Q8C145 765 aa15.68■□□□□ 0.1
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Usp16Q99LG0 825 aa15.68■□□□□ 0.1
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ankrd50F7BE84 1390 aa15.67■□□□□ 0.1
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Lama4P97927 1816 aa15.67■□□□□ 0.1
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Esco1Q69Z69 843 aa15.67■□□□□ 0.1
Cbx1-202ENSMUST00000079702 SympkQ80X82 1284 aa15.67■□□□□ 0.1
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Trim52Q8CDV4 233 aa15.67■□□□□ 0.1
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa15.67■□□□□ 0.1
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ttc21aQ8C0S4 1314 aa15.67■□□□□ 0.1
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Plekhh1Q80TI1 1356 aa15.66■□□□□ 0.1
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Wdhd1P59328 1117 aa15.66■□□□□ 0.1
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Morc2aQ69ZX6 1030 aa15.66■□□□□ 0.1
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tktl2Q9D4D4 627 aa15.66■□□□□ 0.1
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Snai1Q02085 264 aa15.65■□□□□ 0.1
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Neurod2Q62414 383 aa15.65■□□□□ 0.1
Cbx1-202ENSMUST00000079702 StrcQ8VIM6 1809 aa15.64■□□□□ 0.09
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rbm25B2RY56 838 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cfap70D3YVL2 1141 aa15.64■□□□□ 0.09
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tgfb2P27090 414 aa15.64■□□□□ 0.09
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Slf2Q6P9P0 1278 aa15.64■□□□□ 0.09
Cbx1-202ENSMUST00000079702 SowahdQ8BY98 327 aa15.63■□□□□ 0.09
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ambra1A2AH22 1300 aa15.63■□□□□ 0.09
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Sipa1l3G3X9J0 1776 aa15.62■□□□□ 0.09
Cbx1-202ENSMUST00000079702 BcorQ8CGN4 1759 aa15.62■□□□□ 0.09
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Prdm11A2AGX3 565 aa15.62■□□□□ 0.09
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Anks4bQ8K3X6 423 aa15.62■□□□□ 0.09
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ssc5dQ8BV57 1371 aa15.62■□□□□ 0.09
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gnl3lQ6PGG6 577 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Sgip1Q8VD37 806 aa15.61■□□□□ 0.09
Cbx1-202ENSMUST00000079702 NudcO35685 332 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Igfbp6P47880 238 aa15.6■□□□□ 0.09
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cyp2c67Q569X9 491 aa15.6■□□□□ 0.09
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Nlrp3Q8R4B8 1033 aa15.6■□□□□ 0.09
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Taf1dQ9D4V4 322 aa15.6■□□□□ 0.09
Cbx1-202ENSMUST00000079702 NgdnQ9DB96 315 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Slurp2P0DP59 97 aa15.59■□□□□ 0.09
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ifit1bl2Q3U687 466 aa15.59■□□□□ 0.09
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rnf180Q3U827 592 aa15.59■□□□□ 0.09
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ankle2Q6P1H6 964 aa15.59■□□□□ 0.09
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Camkk2Q8C078 588 aa15.59■□□□□ 0.09
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Kcnn1Q9EQR3 537 aa15.59■□□□□ 0.09
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cnksr1A2A9K7 700 aa15.58■□□□□ 0.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ttll7A4Q9F0 912 aa15.58■□□□□ 0.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Znf703P0CL69 594 aa15.58■□□□□ 0.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Arid3aQ62431 601 aa15.58■□□□□ 0.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ccdc30Q8BVF4 654 aa15.57■□□□□ 0.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tango6Q8C3S2 1079 aa15.57■□□□□ 0.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 IarsQ8BU30 1262 aa15.56■□□□□ 0.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rnaseh2aQ9CWY8 301 aa15.56■□□□□ 0.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Duox1A2AQ92 1551 aa15.56■□□□□ 0.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ksr2Q3UVC0 959 aa15.55■□□□□ 0.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Zcwpw1Q6IR42 630 aa15.55■□□□□ 0.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Trim34aQ99PP6 485 aa15.55■□□□□ 0.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cyp2c23E9Q5K4 494 aa15.54■□□□□ 0.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Npy5rO70342 466 aa15.54■□□□□ 0.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Lmnb1P14733 588 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Fkbp1aP26883 108 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rtkn2Q14B46 604 aa15.54■□□□□ 0.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 CoilQ5SU73 570 aa15.54■□□□□ 0.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 SnrkQ8VDU5 748 aa15.54■□□□□ 0.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Mapk8ip1Q9WVI9 707 aa15.54■□□□□ 0.08
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Kank1E9Q238 1360 aa15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 11.7 ms