RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000062069.5

Ptgs1-201, Transcript of Prostaglandin G/H synthase 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptgs1, Length 2,867 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Ahnak2E9PYB0 1738 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Hoxa7P02830 229 aa18.61■□□□□ 0.57
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Gjb2Q00977 226 aa18.61■□□□□ 0.57
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Rad50P70388 1312 aa18.61■□□□□ 0.57
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Cnksr1A2A9K7 700 aa18.6■□□□□ 0.57
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Cfdp1O88271 295 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Cct4P80315 539 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Map3k13Q1HKZ5 959 aa18.6■□□□□ 0.57
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Scn7aB1AYL1 1681 aa18.6■□□□□ 0.57
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Slc35g1Q8BY79 368 aa18.6■□□□□ 0.57
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Amotl2Q8K371 772 aa18.6■□□□□ 0.57
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Ripk4Q9ERK0 786 aa18.6■□□□□ 0.57
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 PtprvP70289 1705 aa18.59■□□□□ 0.57
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Gzf1Q4VBD9 706 aa18.59■□□□□ 0.57
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Casc1Q6TDU8 730 aa18.59■□□□□ 0.57
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Brf1Q8CFK2 676 aa18.59■□□□□ 0.57
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Ccar2Q8VDP4 922 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Olfml1Q8BSH2 233 aa18.59■□□□□ 0.57
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Mknk2Q8CDB0 459 aa18.59■□□□□ 0.57
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Fkbp4P30416 458 aa18.58■□□□□ 0.57
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Bms1Q6PGF5 1284 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Eif4a1P60843 406 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Arhgef1Q61210 920 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Mphosph10Q810V0 681 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Pnma3Q8JZW8 466 aa18.58■□□□□ 0.56
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Sytl4Q9R0Q1 673 aa18.58■□□□□ 0.56
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Rad17Q6NXW6 688 aa18.57■□□□□ 0.56
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Bend3Q6PAL0 825 aa18.57■□□□□ 0.56
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Naa30Q8CES0 364 aa18.57■□□□□ 0.56
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Tceal9Q9DD24 104 aa18.57■□□□□ 0.56
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Mon2Q80TL7 1715 aa18.57■□□□□ 0.56
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Arap3Q8R5G7 1538 aa18.57■□□□□ 0.56
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Pcmtd1P59913 357 aa18.57■□□□□ 0.56
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Gse1Q3U3C9 1213 aa18.57■□□□□ 0.56
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Rufy3Q9D394 469 aa18.57■□□□□ 0.56
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 D430041D05RikF6ZGR6 1678 aa18.57■□□□□ 0.56
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Arfgef2A2A5R2 1792 aa18.57■□□□□ 0.56
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Brpf1B2RRD7 1212 aa18.56■□□□□ 0.56
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 EspnlQ3UYR4 1005 aa18.56■□□□□ 0.56
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Smc3Q9CW03 1217 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Fyb1O35601 819 aa18.56■□□□□ 0.56
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Tex2Q6ZPJ0 1128 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Echdc1Q9D9V3 322 aa18.56■□□□□ 0.56
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Top1mtQ8R4U6 593 aa18.55■□□□□ 0.56
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Amotl1Q9D4H4 968 aa18.55■□□□□ 0.56
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Stx6Q9JKK1 255 aa18.55■□□□□ 0.56
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Zfp804bA0A0G2JGH6 1343 aa18.55■□□□□ 0.56
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 F2rP30558 430 aa18.55■□□□□ 0.56
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Bcl2l13P59017 434 aa18.55■□□□□ 0.56
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Mindy4Q3UQI9 744 aa18.55■□□□□ 0.56
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Atg3Q9CPX6 314 aa18.55■□□□□ 0.56
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Tmem94Q7TSH8 1360 aa18.54■□□□□ 0.56
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Wdr93Q402B2 695 aa18.54■□□□□ 0.56
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 EappQ5BU09 281 aa18.54■□□□□ 0.56
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Samm50Q8BGH2 469 aa18.54■□□□□ 0.56
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Babam1Q3UI43 333 aa18.53■□□□□ 0.56
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Tgfb1i1Q62219 461 aa18.53■□□□□ 0.56
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 C5P06684 1680 aa18.53■□□□□ 0.56
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Syt1P46096 421 aa18.53■□□□□ 0.56
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Pa2g4P50580 394 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Anp32cQ64G17 123 aa18.52■□□□□ 0.56
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Btbd11Q6GQW0 1109 aa18.52■□□□□ 0.56
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Ano8Q6PB70 1060 aa18.52■□□□□ 0.56
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Als2Q920R0 1651 aa18.52■□□□□ 0.56
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Ppfia1B2RXQ2 1266 aa18.52■□□□□ 0.56
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Tti2Q8BGV4 512 aa18.52■□□□□ 0.56
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Zbtb45Q52KG4 520 aa18.52■□□□□ 0.55
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 TatQ8QZR1 454 aa18.52■□□□□ 0.55
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Add2Q9QYB8 725 aa18.52■□□□□ 0.55
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Ccdc173A0JLY1 547 aa18.51■□□□□ 0.55
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Usp48Q3V0C5 1052 aa18.51■□□□□ 0.55
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 DpydQ8CHR6 1025 aa18.51■□□□□ 0.55
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Adcy9P51830 1353 aa18.51■□□□□ 0.55
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Ube2hP62257 183 aa18.5■□□□□ 0.55
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Ifit2Q64112 472 aa18.5■□□□□ 0.55
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Ccdc178Q8CDV0 866 aa18.5■□□□□ 0.55
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Rims2Q9EQZ7 1530 aa18.5■□□□□ 0.55
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Map3k2Q61083 619 aa18.5■□□□□ 0.55
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Q9D9S1 216 aa18.5■□□□□ 0.55
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Dlg5E9Q9R9 1921 aa18.49■□□□□ 0.55
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Fam184aE9PW83 1143 aa18.49■□□□□ 0.55
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Fam228bQ497Q6 232 aa18.49■□□□□ 0.55
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Taf5lQ91WQ5 589 aa18.49■□□□□ 0.55
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Mad1l1Q9WTX8 717 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Nphp3Q7TNH6 1325 aa18.49■□□□□ 0.55
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Nkx2-3P97334 362 aa18.48■□□□□ 0.55
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Cdca7lQ922M5 438 aa18.48■□□□□ 0.55
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Mcm3P25206 812 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Med4Q9CQA5 270 aa18.48■□□□□ 0.55
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Zbtb22Q9Z0G7 638 aa18.48■□□□□ 0.55
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Nup153E9Q3G8 1462 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Adcy5P84309 1262 aa18.48■□□□□ 0.55
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Bach2P97303 839 aa18.48■□□□□ 0.55
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Zfp51Q3U4L8 781 aa18.48■□□□□ 0.55
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Tbc1d30Q69ZT9 766 aa18.48■□□□□ 0.55
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Zscan22Q8BGS5 496 aa18.48■□□□□ 0.55
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Cchcr1Q8K2I2 770 aa18.48■□□□□ 0.55
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Col1a2Q01149 1372 aa18.47■□□□□ 0.55
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Utp3Q9JI13 469 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Edc3Q8K2D3 508 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 13.8 ms