RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000132397.1

Gm20517-202, Transcript of Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gm20517, Length 4,807 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Mat2aQ3THS6 395 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Proser3Q7TSA6 634 aa16.47■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Fut11Q8BHC9 489 aa16.47■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Bbox1Q924Y0 387 aa16.47■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rnf144aQ925F3 292 aa16.47■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Noa1Q9JJG9 693 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 2610001J05RikF2Z3Y9 59 aa16.47■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Zfp715G3X9T1 886 aa16.47■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Prf1P10820 554 aa16.47■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Dcst1Q059Y8 732 aa16.47■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Igfbp5Q07079 271 aa16.47■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 PtprcapQ64697 197 aa16.47■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vmn1r188Q8K3N2 308 aa16.47■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr659Q8VGV6 322 aa16.47■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Spata13Q5DU57 656 aa16.46■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Paqr3Q6TCG8 311 aa16.46■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Slc36a1Q8K4D3 475 aa16.46■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Fam161aQ8QZV6 448 aa16.46■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Nudt7Q99P30 236 aa16.46■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rnf128Q9D304 428 aa16.46■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gde1Q9JL56 331 aa16.46■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Upk1bQ9Z2C6 260 aa16.46■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 5830411N06RikB3F5L4 1112 aa16.46■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ncam1P13595 1115 aa16.46■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Esr1P19785 599 aa16.46■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Fgf1P61148 155 aa16.46■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Crispld1Q8CGD2 500 aa16.46■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Necab3Q9D6J4 353 aa16.46■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Dnajb9Q9QYI6 222 aa16.46■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ralgps1A2AR50 585 aa16.46■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rdh8D3Z6W3 317 aa16.46■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gja1P23242 382 aa16.46■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ptger3P30557 365 aa16.46■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 DhpsQ3TXU5 369 aa16.46■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cxcl16Q8BSU2 246 aa16.46■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cd209eQ91ZW7 208 aa16.46■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Zfp84Q9D654 559 aa16.46■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cmpk1Q9DBP5 196 aa16.46■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ptdss2Q9Z1X2 473 aa16.46■□□□□ 0.23
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Myo18aQ9JMH9 2050 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 4932443I19RikA0A286YE38 169 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Armc4B2RY50 1037 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vmn2r21K7N6Y7 853 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vmn2r20L7N2B1 853 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Stc1O55183 247 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Serpine1P22777 402 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr616Q3KPB0 317 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Dnaaf3Q3UYV8 586 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 MertkQ60805 994 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rslcan18Q7M6X5 460 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gprc6aQ8K4Z6 928 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Txndc17Q9CQM5 123 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Zfp949E9Q732 603 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm20503G3UZK1 150 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Zfp275G3X904 499 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ring1O35730 406 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cldn2O88552 230 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 AhcyP50247 432 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Adra1bP97717 514 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 PgrQ00175 926 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 IpmkQ7TT16 396 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Zcchc3Q8BPK2 400 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Q8BZE1 841 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Zhx3Q8C0Q2 951 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Clrn1Q8K445 232 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 DcxrQ91X52 244 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Lmx1aQ9JKU8 382 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm33543A0A1B0GSI5 81 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Btnl6A2CG22 539 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vmn2r102L7N279 857 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm8906L7N2A2 181 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Npc1O35604 1277 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 WarsP32921 481 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Pld2P97813 933 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 ChatQ03059 641 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 StimateQ3UF25 288 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ugt2b35Q8BJL9 529 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Plpp3Q99JY8 312 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Bpifa3Q9D9J8 232 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tdp2Q9JJX7 370 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ptges3Q9R0Q7 160 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vmn2r-ps130A0A140T8U3 855 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cyp4a32A2A8T1 509 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr1153A2AVC0 318 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm11239E9Q5Z9 360 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm11237F2Z3W5 360 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm11238F2Z478 360 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ptpn20O55082 426 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Slc22a8O88909 537 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Nudt1P53368 156 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Lim2P56563 173 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 PrkacbP68181 351 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tuba1cP68373 449 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm428Q3UTE2 360 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 HjurpQ6PG16 667 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Snx4Q91YJ2 450 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 MtpapQ9D0D3 585 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Inpp5eQ9JII1 647 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tuba8Q9JJZ2 449 aa16.45■□□□□ 0.22
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm28576A0A087WRP6 222 aa16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.1 ms