Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
Tuba8Q9JJZ2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Tuba8Q9JJZ2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Tuba8Q9JJZ2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Tuba8Q9JJZ2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Tuba8Q9JJZ2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Tuba8Q9JJZ2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Tuba8Q9JJZ2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Tuba8Q9JJZ2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Tuba8Q9JJZ2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Tuba8Q9JJZ2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Tuba8Q9JJZ2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Tuba8Q9JJZ2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tuba8Q9JJZ2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tuba8Q9JJZ2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tuba8Q9JJZ2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Tuba8Q9JJZ2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tuba8Q9JJZ2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tuba8Q9JJZ2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tuba8Q9JJZ2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tuba8Q9JJZ2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tuba8Q9JJZ2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Tuba8Q9JJZ2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tuba8Q9JJZ2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tuba8Q9JJZ2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tuba8Q9JJZ2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tuba8Q9JJZ2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tuba8Q9JJZ2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tuba8Q9JJZ2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Tuba8Q9JJZ2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tuba8Q9JJZ2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tuba8Q9JJZ2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tuba8Q9JJZ2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tuba8Q9JJZ2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tuba8Q9JJZ2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tuba8Q9JJZ2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tuba8Q9JJZ2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Tuba8Q9JJZ2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tuba8Q9JJZ2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tuba8Q9JJZ2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tuba8Q9JJZ2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Tuba8Q9JJZ2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tuba8Q9JJZ2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tuba8Q9JJZ2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tuba8Q9JJZ2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tuba8Q9JJZ2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tuba8Q9JJZ2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tuba8Q9JJZ2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Tuba8Q9JJZ2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tuba8Q9JJZ2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tuba8Q9JJZ2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tuba8Q9JJZ2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tuba8Q9JJZ2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tuba8Q9JJZ2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tuba8Q9JJZ2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tuba8Q9JJZ2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tuba8Q9JJZ2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Tuba8Q9JJZ2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tuba8Q9JJZ2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tuba8Q9JJZ2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tuba8Q9JJZ2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Tuba8Q9JJZ2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tuba8Q9JJZ2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tuba8Q9JJZ2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tuba8Q9JJZ2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tuba8Q9JJZ2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tuba8Q9JJZ2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tuba8Q9JJZ2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tuba8Q9JJZ2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tuba8Q9JJZ2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tuba8Q9JJZ2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tuba8Q9JJZ2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tuba8Q9JJZ2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tuba8Q9JJZ2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tuba8Q9JJZ2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tuba8Q9JJZ2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tuba8Q9JJZ2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Tuba8Q9JJZ2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tuba8Q9JJZ2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tuba8Q9JJZ2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tuba8Q9JJZ2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tuba8Q9JJZ2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tuba8Q9JJZ2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tuba8Q9JJZ2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tuba8Q9JJZ2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tuba8Q9JJZ2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tuba8Q9JJZ2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tuba8Q9JJZ2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tuba8Q9JJZ2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tuba8Q9JJZ2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tuba8Q9JJZ2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tuba8Q9JJZ2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tuba8Q9JJZ2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tuba8Q9JJZ2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tuba8Q9JJZ2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tuba8Q9JJZ2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tuba8Q9JJZ2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tuba8Q9JJZ2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tuba8Q9JJZ2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tuba8Q9JJZ2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
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