Protein–RNA interactions for Protein: Q9D304

Rnf128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf128Q9D304 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
Rnf128Q9D304 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rnf128Q9D304 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Rnf128Q9D304 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rnf128Q9D304 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rnf128Q9D304 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Rnf128Q9D304 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Rnf128Q9D304 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Rnf128Q9D304 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Rnf128Q9D304 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Rnf128Q9D304 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Rnf128Q9D304 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rnf128Q9D304 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rnf128Q9D304 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rnf128Q9D304 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Rnf128Q9D304 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rnf128Q9D304 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rnf128Q9D304 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rnf128Q9D304 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rnf128Q9D304 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Rnf128Q9D304 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rnf128Q9D304 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rnf128Q9D304 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rnf128Q9D304 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rnf128Q9D304 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rnf128Q9D304 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rnf128Q9D304 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rnf128Q9D304 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rnf128Q9D304 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rnf128Q9D304 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rnf128Q9D304 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rnf128Q9D304 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rnf128Q9D304 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Rnf128Q9D304 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Rnf128Q9D304 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rnf128Q9D304 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rnf128Q9D304 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rnf128Q9D304 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rnf128Q9D304 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rnf128Q9D304 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rnf128Q9D304 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rnf128Q9D304 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rnf128Q9D304 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rnf128Q9D304 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rnf128Q9D304 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rnf128Q9D304 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rnf128Q9D304 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rnf128Q9D304 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rnf128Q9D304 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Rnf128Q9D304 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rnf128Q9D304 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rnf128Q9D304 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rnf128Q9D304 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rnf128Q9D304 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Rnf128Q9D304 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rnf128Q9D304 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rnf128Q9D304 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rnf128Q9D304 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rnf128Q9D304 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rnf128Q9D304 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rnf128Q9D304 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Rnf128Q9D304 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rnf128Q9D304 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rnf128Q9D304 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rnf128Q9D304 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rnf128Q9D304 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rnf128Q9D304 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rnf128Q9D304 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rnf128Q9D304 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rnf128Q9D304 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rnf128Q9D304 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rnf128Q9D304 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rnf128Q9D304 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rnf128Q9D304 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf128Q9D304 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rnf128Q9D304 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Rnf128Q9D304 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rnf128Q9D304 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rnf128Q9D304 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rnf128Q9D304 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rnf128Q9D304 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rnf128Q9D304 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rnf128Q9D304 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Rnf128Q9D304 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnf128Q9D304 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnf128Q9D304 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnf128Q9D304 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rnf128Q9D304 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rnf128Q9D304 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnf128Q9D304 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf128Q9D304 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf128Q9D304 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rnf128Q9D304 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rnf128Q9D304 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf128Q9D304 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf128Q9D304 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf128Q9D304 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rnf128Q9D304 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rnf128Q9D304 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf128Q9D304 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms