Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C6

Upk1b, Uroplakin-1b, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1bQ9Z2C6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
Upk1bQ9Z2C6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31,55■■■□□ 2,64
Upk1bQ9Z2C6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,14■■■□□ 2,58
Upk1bQ9Z2C6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Upk1bQ9Z2C6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,27■■■□□ 2,44
Upk1bQ9Z2C6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Upk1bQ9Z2C6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Upk1bQ9Z2C6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,3
Upk1bQ9Z2C6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Upk1bQ9Z2C6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Upk1bQ9Z2C6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Upk1bQ9Z2C6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Upk1bQ9Z2C6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Upk1bQ9Z2C6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Upk1bQ9Z2C6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,57■■■□□ 2,16
Upk1bQ9Z2C6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28,52■■■□□ 2,16
Upk1bQ9Z2C6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Upk1bQ9Z2C6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Upk1bQ9Z2C6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Upk1bQ9Z2C6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Upk1bQ9Z2C6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Upk1bQ9Z2C6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Upk1bQ9Z2C6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28,06■■■□□ 2,08
Upk1bQ9Z2C6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,99■■■□□ 2,07
Upk1bQ9Z2C6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Upk1bQ9Z2C6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Upk1bQ9Z2C6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Upk1bQ9Z2C6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Upk1bQ9Z2C6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27,67■■■□□ 2,02
Upk1bQ9Z2C6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Upk1bQ9Z2C6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Upk1bQ9Z2C6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,6■■■□□ 2,01
Upk1bQ9Z2C6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,58■■■□□ 2,01
Upk1bQ9Z2C6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Upk1bQ9Z2C6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Upk1bQ9Z2C6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,33■■□□□ 1,97
Upk1bQ9Z2C6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Upk1bQ9Z2C6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Upk1bQ9Z2C6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Upk1bQ9Z2C6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Upk1bQ9Z2C6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Upk1bQ9Z2C6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,18■■□□□ 1,94
Upk1bQ9Z2C6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Upk1bQ9Z2C6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Upk1bQ9Z2C6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,05■■□□□ 1,92
Upk1bQ9Z2C6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Upk1bQ9Z2C6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Upk1bQ9Z2C6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26,91■■□□□ 1,9
Upk1bQ9Z2C6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Upk1bQ9Z2C6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Upk1bQ9Z2C6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,78■■□□□ 1,88
Upk1bQ9Z2C6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Upk1bQ9Z2C6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Upk1bQ9Z2C6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Upk1bQ9Z2C6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Upk1bQ9Z2C6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Upk1bQ9Z2C6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Upk1bQ9Z2C6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Upk1bQ9Z2C6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Upk1bQ9Z2C6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Upk1bQ9Z2C6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26,49■■□□□ 1,83
Upk1bQ9Z2C6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,47■■□□□ 1,83
Upk1bQ9Z2C6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,44■■□□□ 1,82
Upk1bQ9Z2C6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Upk1bQ9Z2C6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Upk1bQ9Z2C6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Upk1bQ9Z2C6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Upk1bQ9Z2C6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Upk1bQ9Z2C6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Upk1bQ9Z2C6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Upk1bQ9Z2C6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Upk1bQ9Z2C6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26,2■■□□□ 1,78
Upk1bQ9Z2C6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26,12■■□□□ 1,77
Upk1bQ9Z2C6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Upk1bQ9Z2C6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Upk1bQ9Z2C6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Upk1bQ9Z2C6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Upk1bQ9Z2C6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,07■■□□□ 1,76
Upk1bQ9Z2C6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Upk1bQ9Z2C6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1,75
Upk1bQ9Z2C6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Upk1bQ9Z2C6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Upk1bQ9Z2C6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Upk1bQ9Z2C6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Upk1bQ9Z2C6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,83■■□□□ 1,73
Upk1bQ9Z2C6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Upk1bQ9Z2C6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Upk1bQ9Z2C6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Upk1bQ9Z2C6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
Upk1bQ9Z2C6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Upk1bQ9Z2C6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Upk1bQ9Z2C6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Upk1bQ9Z2C6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Upk1bQ9Z2C6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Upk1bQ9Z2C6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Upk1bQ9Z2C6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Upk1bQ9Z2C6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Upk1bQ9Z2C6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Upk1bQ9Z2C6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Upk1bQ9Z2C6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms