Protein–RNA interactions for Protein: Q64697

Ptprcap, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcapQ64697 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.33■■■■■ 4.37
PtprcapQ64697 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
PtprcapQ64697 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
PtprcapQ64697 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
PtprcapQ64697 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
PtprcapQ64697 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PtprcapQ64697 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PtprcapQ64697 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PtprcapQ64697 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
PtprcapQ64697 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
PtprcapQ64697 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PtprcapQ64697 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
PtprcapQ64697 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PtprcapQ64697 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PtprcapQ64697 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PtprcapQ64697 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PtprcapQ64697 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PtprcapQ64697 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PtprcapQ64697 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PtprcapQ64697 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PtprcapQ64697 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PtprcapQ64697 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
PtprcapQ64697 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PtprcapQ64697 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PtprcapQ64697 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PtprcapQ64697 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
PtprcapQ64697 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PtprcapQ64697 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PtprcapQ64697 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PtprcapQ64697 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PtprcapQ64697 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PtprcapQ64697 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PtprcapQ64697 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PtprcapQ64697 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PtprcapQ64697 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
PtprcapQ64697 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PtprcapQ64697 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
PtprcapQ64697 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PtprcapQ64697 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PtprcapQ64697 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
PtprcapQ64697 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PtprcapQ64697 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PtprcapQ64697 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PtprcapQ64697 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PtprcapQ64697 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
PtprcapQ64697 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PtprcapQ64697 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PtprcapQ64697 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
PtprcapQ64697 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PtprcapQ64697 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
PtprcapQ64697 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PtprcapQ64697 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PtprcapQ64697 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PtprcapQ64697 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
PtprcapQ64697 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PtprcapQ64697 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PtprcapQ64697 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PtprcapQ64697 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PtprcapQ64697 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PtprcapQ64697 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PtprcapQ64697 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PtprcapQ64697 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PtprcapQ64697 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PtprcapQ64697 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PtprcapQ64697 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PtprcapQ64697 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PtprcapQ64697 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PtprcapQ64697 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PtprcapQ64697 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PtprcapQ64697 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
PtprcapQ64697 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PtprcapQ64697 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
PtprcapQ64697 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PtprcapQ64697 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PtprcapQ64697 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PtprcapQ64697 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PtprcapQ64697 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PtprcapQ64697 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PtprcapQ64697 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
PtprcapQ64697 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PtprcapQ64697 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PtprcapQ64697 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PtprcapQ64697 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PtprcapQ64697 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PtprcapQ64697 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PtprcapQ64697 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PtprcapQ64697 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
PtprcapQ64697 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PtprcapQ64697 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PtprcapQ64697 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PtprcapQ64697 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PtprcapQ64697 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PtprcapQ64697 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PtprcapQ64697 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PtprcapQ64697 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PtprcapQ64697 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PtprcapQ64697 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PtprcapQ64697 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PtprcapQ64697 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PtprcapQ64697 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms