Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WRP6

Gm28576, Predicted gene 28576, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28576A0A087WRP6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Gm28576A0A087WRP6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Gm28576A0A087WRP6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Gm28576A0A087WRP6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gm28576A0A087WRP6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gm28576A0A087WRP6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Gm28576A0A087WRP6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gm28576A0A087WRP6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gm28576A0A087WRP6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gm28576A0A087WRP6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gm28576A0A087WRP6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gm28576A0A087WRP6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Gm28576A0A087WRP6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gm28576A0A087WRP6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gm28576A0A087WRP6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gm28576A0A087WRP6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gm28576A0A087WRP6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Gm28576A0A087WRP6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gm28576A0A087WRP6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gm28576A0A087WRP6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Gm28576A0A087WRP6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gm28576A0A087WRP6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gm28576A0A087WRP6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gm28576A0A087WRP6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gm28576A0A087WRP6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm28576A0A087WRP6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gm28576A0A087WRP6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gm28576A0A087WRP6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gm28576A0A087WRP6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gm28576A0A087WRP6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gm28576A0A087WRP6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gm28576A0A087WRP6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gm28576A0A087WRP6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Gm28576A0A087WRP6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gm28576A0A087WRP6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gm28576A0A087WRP6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm28576A0A087WRP6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm28576A0A087WRP6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm28576A0A087WRP6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm28576A0A087WRP6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm28576A0A087WRP6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm28576A0A087WRP6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gm28576A0A087WRP6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm28576A0A087WRP6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm28576A0A087WRP6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm28576A0A087WRP6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm28576A0A087WRP6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gm28576A0A087WRP6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gm28576A0A087WRP6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm28576A0A087WRP6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm28576A0A087WRP6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm28576A0A087WRP6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm28576A0A087WRP6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm28576A0A087WRP6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Gm28576A0A087WRP6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gm28576A0A087WRP6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gm28576A0A087WRP6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm28576A0A087WRP6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm28576A0A087WRP6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm28576A0A087WRP6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm28576A0A087WRP6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm28576A0A087WRP6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm28576A0A087WRP6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm28576A0A087WRP6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm28576A0A087WRP6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm28576A0A087WRP6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm28576A0A087WRP6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm28576A0A087WRP6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm28576A0A087WRP6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm28576A0A087WRP6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm28576A0A087WRP6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm28576A0A087WRP6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm28576A0A087WRP6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm28576A0A087WRP6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm28576A0A087WRP6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm28576A0A087WRP6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm28576A0A087WRP6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm28576A0A087WRP6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm28576A0A087WRP6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gm28576A0A087WRP6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm28576A0A087WRP6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm28576A0A087WRP6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm28576A0A087WRP6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm28576A0A087WRP6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm28576A0A087WRP6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm28576A0A087WRP6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm28576A0A087WRP6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm28576A0A087WRP6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm28576A0A087WRP6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm28576A0A087WRP6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm28576A0A087WRP6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm28576A0A087WRP6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm28576A0A087WRP6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm28576A0A087WRP6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm28576A0A087WRP6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm28576A0A087WRP6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm28576A0A087WRP6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm28576A0A087WRP6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm28576A0A087WRP6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm28576A0A087WRP6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
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