Protein–RNA interactions for Protein: O55183

Stc1, Stanniocalcin-1, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stc1O55183 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37,4■■■■□ 3,58
Stc1O55183 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Stc1O55183 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Stc1O55183 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
Stc1O55183 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32,96■■■□□ 2,87
Stc1O55183 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,84■■■□□ 2,85
Stc1O55183 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,57■■■□□ 2,8
Stc1O55183 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32,3■■■□□ 2,76
Stc1O55183 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32,29■■■□□ 2,76
Stc1O55183 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Stc1O55183 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
Stc1O55183 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Stc1O55183 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,34■■■□□ 2,61
Stc1O55183 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,27■■■□□ 2,6
Stc1O55183 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
Stc1O55183 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31,12■■■□□ 2,57
Stc1O55183 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Stc1O55183 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Stc1O55183 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Stc1O55183 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Stc1O55183 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Stc1O55183 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,5
Stc1O55183 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Stc1O55183 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Stc1O55183 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Stc1O55183 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30,4■■■□□ 2,46
Stc1O55183 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Stc1O55183 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,37■■■□□ 2,45
Stc1O55183 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30,24■■■□□ 2,43
Stc1O55183 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Stc1O55183 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Stc1O55183 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Stc1O55183 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Stc1O55183 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29,95■■■□□ 2,39
Stc1O55183 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29,85■■■□□ 2,37
Stc1O55183 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Stc1O55183 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Stc1O55183 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,59■■■□□ 2,33
Stc1O55183 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Stc1O55183 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Stc1O55183 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Stc1O55183 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29,42■■■□□ 2,3
Stc1O55183 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Stc1O55183 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29,41■■■□□ 2,3
Stc1O55183 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Stc1O55183 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Stc1O55183 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29,36■■■□□ 2,29
Stc1O55183 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29,14■■■□□ 2,26
Stc1O55183 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Stc1O55183 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Stc1O55183 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Stc1O55183 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Stc1O55183 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Stc1O55183 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28,96■■■□□ 2,23
Stc1O55183 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Stc1O55183 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28,9■■■□□ 2,22
Stc1O55183 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,21
Stc1O55183 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,88■■■□□ 2,21
Stc1O55183 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Stc1O55183 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28,84■■■□□ 2,21
Stc1O55183 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28,71■■■□□ 2,19
Stc1O55183 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Stc1O55183 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Stc1O55183 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Stc1O55183 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,65■■■□□ 2,18
Stc1O55183 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Stc1O55183 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Stc1O55183 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28,58■■■□□ 2,17
Stc1O55183 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Stc1O55183 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,55■■■□□ 2,16
Stc1O55183 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Stc1O55183 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,16
Stc1O55183 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28,51■■■□□ 2,15
Stc1O55183 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Stc1O55183 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,15
Stc1O55183 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28,39■■■□□ 2,14
Stc1O55183 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,39■■■□□ 2,13
Stc1O55183 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Stc1O55183 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,33■■■□□ 2,13
Stc1O55183 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Stc1O55183 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28,23■■■□□ 2,11
Stc1O55183 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Stc1O55183 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Stc1O55183 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Stc1O55183 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Stc1O55183 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Stc1O55183 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28,02■■■□□ 2,08
Stc1O55183 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27,95■■■□□ 2,06
Stc1O55183 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Stc1O55183 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Stc1O55183 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27,91■■■□□ 2,06
Stc1O55183 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Stc1O55183 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Stc1O55183 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Stc1O55183 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27,85■■■□□ 2,05
Stc1O55183 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Stc1O55183 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Stc1O55183 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Stc1O55183 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Stc1O55183 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27,4 ms