Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ptpn20O55082 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ptpn20O55082 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ptpn20O55082 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ptpn20O55082 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Ptpn20O55082 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Ptpn20O55082 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ptpn20O55082 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ptpn20O55082 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ptpn20O55082 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ptpn20O55082 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ptpn20O55082 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ptpn20O55082 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ptpn20O55082 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ptpn20O55082 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ptpn20O55082 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ptpn20O55082 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ptpn20O55082 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ptpn20O55082 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ptpn20O55082 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ptpn20O55082 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ptpn20O55082 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ptpn20O55082 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ptpn20O55082 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ptpn20O55082 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ptpn20O55082 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ptpn20O55082 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ptpn20O55082 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ptpn20O55082 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ptpn20O55082 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ptpn20O55082 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ptpn20O55082 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ptpn20O55082 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ptpn20O55082 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ptpn20O55082 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ptpn20O55082 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ptpn20O55082 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ptpn20O55082 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ptpn20O55082 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ptpn20O55082 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ptpn20O55082 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ptpn20O55082 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ptpn20O55082 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ptpn20O55082 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ptpn20O55082 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ptpn20O55082 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ptpn20O55082 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ptpn20O55082 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ptpn20O55082 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ptpn20O55082 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Ptpn20O55082 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ptpn20O55082 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ptpn20O55082 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ptpn20O55082 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ptpn20O55082 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ptpn20O55082 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ptpn20O55082 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ptpn20O55082 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ptpn20O55082 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ptpn20O55082 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ptpn20O55082 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ptpn20O55082 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ptpn20O55082 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ptpn20O55082 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ptpn20O55082 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ptpn20O55082 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ptpn20O55082 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ptpn20O55082 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ptpn20O55082 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ptpn20O55082 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ptpn20O55082 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ptpn20O55082 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ptpn20O55082 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ptpn20O55082 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ptpn20O55082 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ptpn20O55082 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ptpn20O55082 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ptpn20O55082 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ptpn20O55082 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ptpn20O55082 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ptpn20O55082 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ptpn20O55082 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ptpn20O55082 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ptpn20O55082 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ptpn20O55082 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ptpn20O55082 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ptpn20O55082 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ptpn20O55082 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ptpn20O55082 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ptpn20O55082 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptpn20O55082 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptpn20O55082 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ptpn20O55082 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ptpn20O55082 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ptpn20O55082 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptpn20O55082 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ptpn20O55082 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ptpn20O55082 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ptpn20O55082 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ptpn20O55082 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms