RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470089.5

FBXO18-208, Transcript of F-box DNA helicase 1, humanhuman

TSL 5

Gene FBXO18, Length 979 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO18-208ENST00000470089 SLC17A6Q9P2U8 582 aa28.27■■■□□ 2.12
FBXO18-208ENST00000470089 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
FBXO18-208ENST00000470089 PADI1Q9ULC6 663 aa28.27■■■□□ 2.12
FBXO18-208ENST00000470089 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 NKX2-8O15522 239 aa28.26■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 MATN4O95460 622 aa28.26■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 MT-ND3P03897 115 aa28.26■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 CARSP49589 748 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 SLC5A12Q1EHB4 618 aa28.26■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 ANKMY2Q8IV38 441 aa28.26■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 KCNJ9Q92806 393 aa28.26■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 CERS2Q96G23 380 aa28.26■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 GPR21Q99679 349 aa28.26■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 EFHD1Q9BUP0 239 aa28.26■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 DPH5Q9H2P9 285 aa28.26■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 KLHL20Q9Y2M5 609 aa28.26■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 TEX264Q9Y6I9 313 aa28.26■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 RAD51CO43502 376 aa28.25■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 PRKAR1AP10644 381 aa28.25■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 CCNFP41002 786 aa28.25■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 LY6DQ14210 128 aa28.25■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 TTLL9Q3SXZ7 439 aa28.25■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 SLC38A9Q8NBW4 561 aa28.25■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 CT55Q8WUE5 264 aa28.25■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 STARD8Q92502 1023 aa28.25■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 TCTN2Q96GX1 697 aa28.25■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 NDNQ99608 321 aa28.25■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa28.25■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 SYTL2Q9HCH5 934 aa28.25■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 MRFAP1Q9Y605 127 aa28.25■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 HCRTR1O43613 425 aa28.24■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 KATNA1O75449 491 aa28.24■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 MSL3P1P0C860 447 aa28.24■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 GPS2Q13227 327 aa28.24■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 MAGEC3Q8TD91 643 aa28.24■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 DENND1AQ8TEH3 1009 aa28.24■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 SERTAD3Q9UJW9 196 aa28.24■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 DHRS7Q9Y394 339 aa28.24■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 COMMD10Q9Y6G5 202 aa28.24■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 FAM187AA6NFU0 413 aa28.23■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 ARHGEF33A8MVX0 844 aa28.23■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 TCN2P20062 427 aa28.23■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 CYP2A7P20853 494 aa28.23■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 MAGP20916 626 aa28.23■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 GABRB3P28472 473 aa28.23■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 TBR1Q16650 682 aa28.23■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 LINC00303Q3SY05 128 aa28.23■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 C16orf46Q6P387 395 aa28.23■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 RAB42Q8N4Z0 105 aa28.23■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 CD200R1Q8TD46 325 aa28.23■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 INPP5DQ92835 1189 aa28.23■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 SLC22A18Q96BI1 424 aa28.23■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 LRRC39Q96DD0 335 aa28.23■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 RUFY1Q96T51 708 aa28.23■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 TERTO14746 1132 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 PSMB5P28074 263 aa28.22■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 ITGA1P56199 1179 aa28.22■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 DNASE1L3Q13609 305 aa28.22■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 SF1Q15637 639 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa28.22■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 STEAP4Q687X5 459 aa28.22■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 MAATS1Q7Z4T9 603 aa28.22■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 CNTN4Q8IWV2 1026 aa28.22■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 CPNE9Q8IYJ1 553 aa28.22■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 MR1Q95460 341 aa28.22■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 CLIP3Q96DZ5 547 aa28.22■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 WBP1Q96G27 269 aa28.22■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 ERP44Q9BS26 406 aa28.22■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 KLHL42Q9P2K6 505 aa28.22■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa28.22■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 ATRXP46100 2492 aa28.21■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 TK2O00142 265 aa28.21■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 VPS26AO75436 327 aa28.21■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 AHSGP02765 367 aa28.21■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 ITGB2P05107 769 aa28.21■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 CTSBP07858 339 aa28.21■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 GABRA4P48169 554 aa28.21■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 CDC20Q12834 499 aa28.21■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa28.21■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 NEK10Q6ZWH5 1172 aa28.21■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 FBXO36Q8NEA4 188 aa28.21■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 OR9A1PQ8NGU1 263 aa28.21■■■□□ 2.11
FBXO18-208ENST00000470089 SEMA4CQ9C0C4 833 aa28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms