RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeastyeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3YPR069C CLB5P30283 435 aa8.02□□□□□ -1.13
SPE3YPR069C CIC1P38779 376 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
SPE3YPR069C ASE1P50275 885 aa8.02□□□□□ -1.13
SPE3YPR069C CUS1Q02554 436 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
SPE3YPR069C TOR1P35169 2470 aa8.02□□□□□ -1.13
SPE3YPR069C SES1P07284 462 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
SPE3YPR069C POL3P15436 1097 aa8.01□□□□□ -1.13
SPE3YPR069C INP51P40559 946 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
SPE3YPR069C SKY1Q03656 742 aa8.01□□□□□ -1.13
SPE3YPR069C DAP1Q12091 152 aa8.01□□□□□ -1.13
SPE3YPR069C ARP6Q12509 438 aa8.01□□□□□ -1.13
SPE3YPR069C IDI1P15496 288 aa8□□□□□ -1.13
SPE3YPR069C SUL1P38359 859 aa8□□□□□ -1.13
SPE3YPR069C CCT3P39077 534 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
SPE3YPR069C MDR1P53258 950 aa8□□□□□ -1.13
SPE3YPR069C EMI2Q04409 500 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
SPE3YPR069C PGA3Q12746 312 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
SPE3YPR069C CIT1P00890 479 aa7.99□□□□□ -1.13
SPE3YPR069C SPT2P06843 333 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
SPE3YPR069C YEL025CP39991 1188 aa7.99□□□□□ -1.13
SPE3YPR069C HUL5P53119 910 aa7.99□□□□□ -1.13
SPE3YPR069C ECM23Q02710 187 aa7.99□□□□□ -1.13
SPE3YPR069C GDE1Q02979 1223 aa7.99□□□□□ -1.13
SPE3YPR069C MSS51P32335 436 aa7.98□□□□□ -1.13
SPE3YPR069C SMY2P32909 740 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
SPE3YPR069C UBP11P36026 717 aa7.98□□□□□ -1.13
SPE3YPR069C MET13P53128 600 aa7.98□□□□□ -1.13
SPE3YPR069C YNL034WP53963 612 aa7.98□□□□□ -1.13
SPE3YPR069C YNL018CP53976 612 aa7.98□□□□□ -1.13
SPE3YPR069C ORC4P54791 529 aa7.98□□□□□ -1.13
SPE3YPR069C OYE2Q03558 400 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
SPE3YPR069C YDR341CQ05506 607 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
SPE3YPR069C PHM6Q05637 104 aa7.98□□□□□ -1.13
SPE3YPR069C OXR1Q08952 273 aa7.98□□□□□ -1.13
SPE3YPR069C CCH1P50077 2039 aa7.97□□□□□ -1.13
SPE3YPR069C UBC1P21734 215 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
SPE3YPR069C ISW1P38144 1129 aa7.97□□□□□ -1.13
SPE3YPR069C BRN1P38170 754 aa7.97□□□□□ -1.13
SPE3YPR069C STB5P38699 743 aa7.97□□□□□ -1.13
SPE3YPR069C PSP2P50109 593 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
SPE3YPR069C GPI13Q07830 1017 aa7.97□□□□□ -1.13
SPE3YPR069C TFC8Q12308 588 aa7.97□□□□□ -1.13
SPE3YPR069C PGK1P00560 416 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C MET6P05694 767 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C MSD1P15179 658 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C SRO9P25567 434 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C URK1P27515 501 aa7.96□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C FMP10P40098 244 aa7.96□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C SPO22P40511 975 aa7.96□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C OYE3P41816 400 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C INP52P50942 1183 aa7.96□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C ZPR1P53303 486 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C HEH2Q03281 663 aa7.96□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C STI1P15705 589 aaKnown RBP RIP-Chip data7.95□□□□□ -1.14not detected
SPE3YPR069C MAK11P20484 414 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C SYN8P31377 255 aa7.95□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C SLX1P38324 304 aa7.95□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C AKR1P39010 764 aa7.95□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C OPT1P40897 799 aa7.95□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C MAP1Q01662 387 aaKnown RBP RIP-Chip data7.95□□□□□ -1.14not detected
SPE3YPR069C GCR2Q01722 534 aa7.95□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C MMR1Q06324 491 aa7.95□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C MAG2Q06436 670 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C TIF1P10081 395 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C ESS1P22696 170 aa7.94□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C BUD2P33314 1104 aa7.94□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C SIS2P36024 562 aa7.94□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C YGL138CP53122 345 aa7.94□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C HXT17P53631 564 aa7.94□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C CNM67P53865 581 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C CRD1Q07560 283 aa7.94□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C BMH2P34730 273 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C RXT2P38255 430 aa7.93□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C OPY1P38271 328 aa7.93□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C PCI8P40512 444 aa7.93□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C GPD2P41911 440 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C SAD1P43589 448 aa7.93□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C MUK1Q02866 612 aa7.93□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C EFT1P32324 842 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C FBP26P32604 452 aa7.92□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C PGM1P33401 570 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C SAS3P34218 831 aa7.92□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C DRE2P36152 348 aa7.92□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C RDH54P38086 958 aa7.92□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C AIM9P40053 627 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C BNI5P53890 448 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C SUV3P32580 737 aa7.91□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C HXT13P39924 564 aa7.91□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C BUD16P39988 312 aa7.91□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C GCV2P49095 1034 aa7.91□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C YGR273CP53329 174 aa7.91□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C RET3P53600 189 aa7.91□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C YLR455WQ06188 304 aa7.91□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C SWI4P25302 1093 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C MAP2P38174 421 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C APN2P38207 520 aa7.9□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C YAP1801P38856 637 aa7.9□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C MFM1Q02783 413 aa7.9□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C PNG1Q02890 363 aa7.9□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C SPO71Q03868 1245 aa7.9□□□□□ -1.14
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