RNA–Protein interactions for RNA: YMR088C

VBA1, Transcript of Permease of basic amino acids in the vacuolar membrane, yeast

Gene VBA1, Length 1,689 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VBA1	YMR088C	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	VAC17	P25591	423 aa		6	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	YME2	P32843	850 aa		6	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	SEC8	P32855	1065 aa		6	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	MRP8	P35719	219 aa		6	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	TGL4	P36165	910 aa		6	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	VRP1	P37370	817 aa		6	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	TAF5	P38129	798 aa		6	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	FMP10	P40098	244 aa		6	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	YMR018W	Q04364	514 aa		6	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	PGS1	P25578	521 aa		5.99	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	PLC1	P32383	869 aa		5.99	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	UIP5	P36137	443 aa		5.99	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	HSM3	P38348	480 aa		5.99	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	YIR014W	P40570	242 aa		5.99	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	MET12	P46151	657 aa		5.99	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	IML2	P47031	731 aa		5.99	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	YLR352W	Q06479	807 aa		5.99	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	ENV9	Q08651	330 aa		5.99	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	DAL80	P26343	269 aa		5.98	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	PXA2	P34230	853 aa		5.98	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	MIC60	P36112	540 aa		5.98	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	JNM1	P36224	373 aa		5.98	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	APD1	P38281	316 aa		5.98	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	HOL1	P53389	586 aa		5.98	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	YNL144C	P53907	740 aa		5.98	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	MRS2	Q01926	470 aa		5.98	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	YML083C	Q04526	418 aa		5.98	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	KAR5	Q04746	504 aa		5.98	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	ESC2	Q06340	456 aa		5.98	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	CIR2	Q08822	631 aa		5.98	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	YOL098C	Q12496	1037 aa		5.98	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	DIT1	P21623	536 aa		5.98	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	PTH2	P34222	208 aa		5.98	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	YKL100C	P34248	587 aa		5.98	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	RRF1	P38771	230 aa		5.98	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	ESL1	P40456	1118 aa		5.98	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	PHB1	P40961	287 aa		5.98	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	VTC2	P43585	828 aa		5.98	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	CWH41	P53008	833 aa		5.98	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	PEX14	P53112	341 aa		5.98	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	YGL140C	P53120	1219 aa		5.98	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.98	□□□□□ -1.45	not detected
VBA1	YMR088C	YMR102C	Q03177	834 aa		5.98	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	SVF1	Q05515	481 aa		5.98	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	YIG1	Q08956	461 aa		5.98	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	SDH2	P21801	266 aa		5.97	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	OCA4	P25366	362 aa		5.97	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	ITR1	P30605	584 aa		5.97	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	MET4	P32389	672 aa		5.97	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	RRN3	P36070	627 aa		5.97	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	RTS1	P38903	757 aa		5.97	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	KTR7	P40504	517 aa		5.97	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	NUP84	P52891	726 aa		5.97	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	5.97	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	DIP5	P53388	608 aa		5.97	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	INP2	Q03824	705 aa		5.97	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	KRE28	Q04431	385 aa		5.97	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
VBA1	YMR088C	KIP2	P28743	706 aa		5.96	□□□□□ -1.46
VBA1	YMR088C	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
VBA1	YMR088C	MNR2	P35724	969 aa		5.96	□□□□□ -1.46
VBA1	YMR088C	PSY4	P38193	441 aa		5.96	□□□□□ -1.46
VBA1	YMR088C	RIM11	P38615	370 aa		5.96	□□□□□ -1.46
VBA1	YMR088C	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
VBA1	YMR088C	RTT107	P38850	1070 aa		5.96	□□□□□ -1.46
VBA1	YMR088C	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
VBA1	YMR088C	ATG3	P40344	310 aa		5.96	□□□□□ -1.46
VBA1	YMR088C	ALG12	P53730	551 aa		5.96	□□□□□ -1.46
VBA1	YMR088C	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.46
VBA1	YMR088C	ULP1	Q02724	621 aa		5.96	□□□□□ -1.46
VBA1	YMR088C	LCD1	Q04377	747 aa		5.96	□□□□□ -1.46
VBA1	YMR088C	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
VBA1	YMR088C	GNT1	Q12096	491 aa		5.96	□□□□□ -1.46
VBA1	YMR088C	TAF3	Q12297	353 aa		5.96	□□□□□ -1.46
VBA1	YMR088C	RRI2	Q12348	645 aa		5.96	□□□□□ -1.46
VBA1	YMR088C	YRF1-4	O13559	1382 aa		5.96	□□□□□ -1.46

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.1 ms