RNA–Protein interactions for RNA: YMR054W

STV1, Transcript of Subunit a of the vacuolar-ATPase V0 domain, yeast

Gene STV1, Length 2,673 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STV1	YMR054W	PSR2	Q07949	397 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	VBA3	P25594	458 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	PCL2	P25693	308 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	TFC3	P34111	1160 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	TRS130	Q03660	1102 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	MLC2	Q06580	163 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	LYP1	P32487	611 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	SAP185	P40856	1058 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	MEP3	P53390	489 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	MSH6	Q03834	1242 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	MCM1	P11746	286 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	TAF1	P46677	1066 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	MOD5	P07884	428 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	EAP1	P36041	632 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	SAP155	P43612	1002 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	YJR096W	P47137	282 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	HFD1	Q04458	532 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	SCD5	P34758	872 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	MBP1	P39678	833 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	VPS8	P39702	1274 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	MEP1	P40260	492 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	YGL140C	P53120	1219 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	YGR016W	P53209	190 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	CTF4	Q01454	927 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	ISU1	Q03020	165 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	MSB4	Q12317	492 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	ESP1	Q03018	1630 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	DNF2	Q12675	1612 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	UTR2	P32623	467 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	PTH2	P34222	208 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	JNM1	P36224	373 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	GEM1	P39722	662 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	ACA1	P39970	489 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	PKH1	Q03407	766 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	CDC9	P04819	755 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	NUP120	P35729	1037 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	RDH54	P38086	958 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	PAN5	P38787	379 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	HIS6	P40545	261 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	PEX29	Q03370	554 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	SRD1	P09007	221 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	VTC2	P43585	828 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	SIW14	P53965	281 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	MMS1	Q06211	1407 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	CHS3	P29465	1165 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	BEM3	P32873	1128 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	DSS1	P39112	969 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	VPS30	Q02948	557 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	CYB2	P00175	591 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	BSD2	P38356	321 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	PML39	Q03760	334 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	BRE4	Q07660	1125 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	RAD53	P22216	821 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	ANP1	P32629	500 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	YGL015C	P33199	130 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	LDH1	P38139	375 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	QDR2	P40474	542 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	QRI7	P43122	407 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	GPI8	P49018	411 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	GTR1	Q00582	310 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	TRK1	P12685	1235 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	NPL4	P33755	580 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	PEX28	P38848	579 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	KXD1	P53158	218 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	YAP1802	P53309	568 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	PHM6	Q05637	104 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	YLR352W	Q06479	807 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
STV1	YMR054W	FBP26	P32604	452 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	RIM4	P38741	713 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STV1	YMR054W	BCD1	P38772	366 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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