RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042312.13

Trafd1-201, Transcript of TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trafd1, Length 2,503 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Irx6Q9ER75 438 aa27.06■■□□□ 1.92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ptpn23Q6PB44 1692 aa27.05■■□□□ 1.92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zfp777B9EKF4 885 aa27.05■■□□□ 1.92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cwc27Q3TKY6 469 aa27.05■■□□□ 1.92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atp8b2P98199 1209 aa27.04■■□□□ 1.92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mrps27Q8BK72 415 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ap3b2Q9JME5 1082 aa27.04■■□□□ 1.92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mon2Q80TL7 1715 aa27.04■■□□□ 1.92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Myo5bP21271 1818 aa27.03■■□□□ 1.92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ahnak2E9PYB0 1738 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 C5P06684 1680 aa27.02■■□□□ 1.92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Disp3A3KFU9 1347 aa27.02■■□□□ 1.92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Slc35g1Q8BY79 368 aa27.02■■□□□ 1.92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 HypkQ9CR41 129 aa27.02■■□□□ 1.92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Als2Q920R0 1651 aa27.01■■□□□ 1.91
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gtf2a1Q99PM3 378 aa27■■□□□ 1.91
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atf5O70191 283 aa27■■□□□ 1.91
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cyp2d11P24457 504 aa26.99■■□□□ 1.91
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tshz3Q8CGV9 1081 aa26.99■■□□□ 1.91
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Hsp90b1P08113 802 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Trim44Q9QXA7 346 aa26.98■■□□□ 1.91
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pnpla7A2AJ88 1352 aa26.97■■□□□ 1.91
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rnf123Q5XPI3 1314 aa26.97■■□□□ 1.91
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Stk36Q69ZM6 1316 aa26.97■■□□□ 1.91
Trafd1-201ENSMUST00000042312 NexnQ7TPW1 607 aa26.96■■□□□ 1.91
Trafd1-201ENSMUST00000042312 ScaperF8VQ70 1398 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Arfgef2A2A5R2 1792 aa26.96■■□□□ 1.91
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Phactr2B1AVP0 632 aa26.96■■□□□ 1.91
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Vwa3bJ9JI28 736 aa26.96■■□□□ 1.91
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mcmdc2E9Q956 681 aa26.95■■□□□ 1.91
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tpx2A2APB8 745 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm9992B2RWK3 458 aa26.94■■□□□ 1.9
Trafd1-201ENSMUST00000042312 ImpactO55091 318 aa26.94■■□□□ 1.9
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nol8Q3UHX0 1147 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Unc93aQ710D3 458 aa26.94■■□□□ 1.9
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tmem94Q7TSH8 1360 aa26.94■■□□□ 1.9
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mum1Q6DID5 682 aa26.91■■□□□ 1.9
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Amotl2Q8K371 772 aa26.91■■□□□ 1.9
Trafd1-201ENSMUST00000042312 LlphQ9D945 130 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gadd45bP22339 160 aa26.89■■□□□ 1.9
Trafd1-201ENSMUST00000042312 PtmaP26350 111 aa26.89■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 MccE9PWI3 1003 aa26.88■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 EvcP57680 1005 aa26.88■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 PogkQ80TC5 607 aa26.88■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tlr7P58681 1050 aa26.87■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Jakmip1Q8BVL9 626 aa26.87■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pmfbp1Q9WVQ0 1022 aa26.87■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ier5O89113 308 aa26.87■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Arhgef1Q61210 920 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Unc5clQ6R653 518 aa26.87■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 4931400O07RikQ9D4M5 137 aa26.87■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rims2Q9EQZ7 1530 aa26.87■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gsdma3Q5Y4Y6 464 aa26.86■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 AnlnQ8K298 1121 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Znf692Q3U381 531 aa26.86■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cpa2Q504N0 417 aa26.86■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CoilQ5SU73 570 aa26.86■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dlg5E9Q9R9 1921 aa26.86■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm45015A0A140LII9 184 aa26.85■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm18336A0A140LIU8 765 aa26.85■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zap70P43404 618 aa26.85■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Filip1lQ6P6L0 1131 aa26.85■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nol11Q8BJW5 723 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Slc4a10Q5DTL9 1118 aa26.84■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rad17Q6NXW6 688 aa26.84■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 PtmsQ9D0J8 101 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Exoc6bA6H5Z3 810 aa26.84■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ano8Q6PB70 1060 aa26.84■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Eif4a1P60843 406 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cnksr1A2A9K7 700 aa26.83■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fyb1O35601 819 aa26.82■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nkx2-3P97334 362 aa26.82■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Stk3Q9JI10 497 aa26.82■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rrp9Q91WM3 475 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Syce3B5KM66 88 aa26.81■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fkbp4P30416 458 aa26.81■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Anapc15P60007 132 aa26.81■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Map3k13Q1HKZ5 959 aa26.81■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mlh1Q9JK91 760 aa26.81■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pdzrn3Q69ZS0 1063 aa26.81■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Noc3lQ8VI84 807 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Amotl1Q9D4H4 968 aa26.8■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Erich6bQ9D4S6 220 aa26.8■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ms4a2P20490 235 aa26.79■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Bend3Q6PAL0 825 aa26.79■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Slx4ipQ9D7Y9 413 aa26.79■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nup153E9Q3G8 1462 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 TatQ8QZR1 454 aa26.78■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rrp12Q6P5B0 1295 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dhx16G3X8X0 1044 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cfdp1O88271 295 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Bcl2l13P59017 434 aa26.77■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 St18Q80TY4 1045 aa26.77■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 C3P01027 1663 aa26.77■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atp6v1dP57746 247 aa26.76■■□□□ 1.87
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rbm27Q5SFM8 1060 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Utp18Q5SSI6 552 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mphosph10Q810V0 681 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nol12Q8BG17 217 aa26.75■■□□□ 1.87
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Elmsan1E9Q2I4 1089 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.4 ms