RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042312.13

Trafd1-201, Transcript of TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trafd1, Length 2,503 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Irx6Q9ER75 438 aa27.06■■□□□ 1.92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ptpn23Q6PB44 1692 aa27.05■■□□□ 1.92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zfp777B9EKF4 885 aa27.05■■□□□ 1.92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cwc27Q3TKY6 469 aa27.05■■□□□ 1.92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atp8b2P98199 1209 aa27.04■■□□□ 1.92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mrps27Q8BK72 415 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ap3b2Q9JME5 1082 aa27.04■■□□□ 1.92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mon2Q80TL7 1715 aa27.04■■□□□ 1.92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Myo5bP21271 1818 aa27.03■■□□□ 1.92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ahnak2E9PYB0 1738 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 C5P06684 1680 aa27.02■■□□□ 1.92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Disp3A3KFU9 1347 aa27.02■■□□□ 1.92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Slc35g1Q8BY79 368 aa27.02■■□□□ 1.92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 HypkQ9CR41 129 aa27.02■■□□□ 1.92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Als2Q920R0 1651 aa27.01■■□□□ 1.91
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gtf2a1Q99PM3 378 aa27■■□□□ 1.91
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atf5O70191 283 aa27■■□□□ 1.91
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cyp2d11P24457 504 aa26.99■■□□□ 1.91
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tshz3Q8CGV9 1081 aa26.99■■□□□ 1.91
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Hsp90b1P08113 802 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Trim44Q9QXA7 346 aa26.98■■□□□ 1.91
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pnpla7A2AJ88 1352 aa26.97■■□□□ 1.91
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rnf123Q5XPI3 1314 aa26.97■■□□□ 1.91
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Stk36Q69ZM6 1316 aa26.97■■□□□ 1.91
Trafd1-201ENSMUST00000042312 NexnQ7TPW1 607 aa26.96■■□□□ 1.91
Trafd1-201ENSMUST00000042312 ScaperF8VQ70 1398 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Arfgef2A2A5R2 1792 aa26.96■■□□□ 1.91
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Phactr2B1AVP0 632 aa26.96■■□□□ 1.91
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Vwa3bJ9JI28 736 aa26.96■■□□□ 1.91
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mcmdc2E9Q956 681 aa26.95■■□□□ 1.91
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tpx2A2APB8 745 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm9992B2RWK3 458 aa26.94■■□□□ 1.9
Trafd1-201ENSMUST00000042312 ImpactO55091 318 aa26.94■■□□□ 1.9
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nol8Q3UHX0 1147 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Unc93aQ710D3 458 aa26.94■■□□□ 1.9
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tmem94Q7TSH8 1360 aa26.94■■□□□ 1.9
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mum1Q6DID5 682 aa26.91■■□□□ 1.9
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Amotl2Q8K371 772 aa26.91■■□□□ 1.9
Trafd1-201ENSMUST00000042312 LlphQ9D945 130 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gadd45bP22339 160 aa26.89■■□□□ 1.9
Trafd1-201ENSMUST00000042312 PtmaP26350 111 aa26.89■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 MccE9PWI3 1003 aa26.88■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 EvcP57680 1005 aa26.88■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 PogkQ80TC5 607 aa26.88■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tlr7P58681 1050 aa26.87■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Jakmip1Q8BVL9 626 aa26.87■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pmfbp1Q9WVQ0 1022 aa26.87■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ier5O89113 308 aa26.87■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Arhgef1Q61210 920 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Unc5clQ6R653 518 aa26.87■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 4931400O07RikQ9D4M5 137 aa26.87■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rims2Q9EQZ7 1530 aa26.87■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gsdma3Q5Y4Y6 464 aa26.86■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 AnlnQ8K298 1121 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Znf692Q3U381 531 aa26.86■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cpa2Q504N0 417 aa26.86■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CoilQ5SU73 570 aa26.86■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dlg5E9Q9R9 1921 aa26.86■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm45015A0A140LII9 184 aa26.85■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm18336A0A140LIU8 765 aa26.85■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zap70P43404 618 aa26.85■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Filip1lQ6P6L0 1131 aa26.85■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nol11Q8BJW5 723 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Slc4a10Q5DTL9 1118 aa26.84■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rad17Q6NXW6 688 aa26.84■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 PtmsQ9D0J8 101 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Exoc6bA6H5Z3 810 aa26.84■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ano8Q6PB70 1060 aa26.84■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Eif4a1P60843 406 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cnksr1A2A9K7 700 aa26.83■■□□□ 1.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fyb1O35601 819 aa26.82■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nkx2-3P97334 362 aa26.82■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Stk3Q9JI10 497 aa26.82■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rrp9Q91WM3 475 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Syce3B5KM66 88 aa26.81■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fkbp4P30416 458 aa26.81■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Anapc15P60007 132 aa26.81■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Map3k13Q1HKZ5 959 aa26.81■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mlh1Q9JK91 760 aa26.81■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pdzrn3Q69ZS0 1063 aa26.81■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Noc3lQ8VI84 807 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Amotl1Q9D4H4 968 aa26.8■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Erich6bQ9D4S6 220 aa26.8■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ms4a2P20490 235 aa26.79■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Bend3Q6PAL0 825 aa26.79■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Slx4ipQ9D7Y9 413 aa26.79■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nup153E9Q3G8 1462 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 TatQ8QZR1 454 aa26.78■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rrp12Q6P5B0 1295 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dhx16G3X8X0 1044 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cfdp1O88271 295 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Bcl2l13P59017 434 aa26.77■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 St18Q80TY4 1045 aa26.77■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 C3P01027 1663 aa26.77■■□□□ 1.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atp6v1dP57746 247 aa26.76■■□□□ 1.87
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rbm27Q5SFM8 1060 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Utp18Q5SSI6 552 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mphosph10Q810V0 681 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nol12Q8BG17 217 aa26.75■■□□□ 1.87
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Elmsan1E9Q2I4 1089 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.4 ms