RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000018755.9

Pdlim4-201, Transcript of PDZ and LIM domain protein 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdlim4, Length 1,182 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Lrrc43Q3V0L5 667 aa29.63■■■□□ 2.33
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Q7TT23 1179 aa29.63■■■□□ 2.33
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Znrd1-asQ8R0E5 213 aa29.61■■■□□ 2.33
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Kndc1Q0KK55 1742 aa29.61■■■□□ 2.33
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa29.61■■■□□ 2.33
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Magea6O89010 325 aa29.6■■■□□ 2.33
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Rad23bP54728 416 aa29.6■■■□□ 2.33
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Magea3Q6T340 320 aa29.6■■■□□ 2.33
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa29.6■■■□□ 2.33
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Tiam2Q6ZPF3 1715 aa29.59■■■□□ 2.33
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ubr3Q5U430 1889 aa29.59■■■□□ 2.33
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 C4bP01029 1738 aa29.57■■■□□ 2.32
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Zswim8Q3UHH1 1832 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Atf7ipQ7TT18 1306 aa29.56■■■□□ 2.32
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Btbd11Q6GQW0 1109 aa29.56■■■□□ 2.32
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Mrps5Q99N87 432 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Mylk2Q8VCR8 613 aa29.54■■■□□ 2.32
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Usp21Q9QZL6 566 aa29.54■■■□□ 2.32
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Plch1Q4KWH5 1682 aa29.53■■■□□ 2.32
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Apaf1O88879 1249 aa29.53■■■□□ 2.32
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Amhr2Q8K592 568 aa29.53■■■□□ 2.32
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 HmcesQ8R1M0 353 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Rnf180Q3U827 592 aa29.5■■■□□ 2.31
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Col11a2Q64739 1736 aa29.5■■■□□ 2.31
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Nav1Q8CH77 1875 aa29.5■■■□□ 2.31
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Sgip1Q8VD37 806 aa29.49■■■□□ 2.31
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Usp19Q3UJD6 1360 aa29.49■■■□□ 2.31
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Cers3Q1A3B0 383 aa29.48■■■□□ 2.31
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 CpzQ8R4V4 654 aa29.48■■■□□ 2.31
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 PigbQ9JJQ0 542 aa29.48■■■□□ 2.31
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Syde2E9PUP1 1314 aa29.47■■■□□ 2.31
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Lrp5Q91VN0 1614 aa29.47■■■□□ 2.31
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ppef1O35655 650 aa29.47■■■□□ 2.31
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Myo5bP21271 1818 aa29.46■■■□□ 2.31
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Zcwpw1Q6IR42 630 aa29.46■■■□□ 2.31
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Znf541Q0GGX2 1363 aa29.46■■■□□ 2.31
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 ScaperF8VQ70 1398 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa29.45■■■□□ 2.31
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Cavin4A2AMM0 362 aa29.44■■■□□ 2.3
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 MetP16056 1379 aa29.43■■■□□ 2.3
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Clcn1Q64347 994 aa29.43■■■□□ 2.3
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Kcnn1Q9EQR3 537 aa29.43■■■□□ 2.3
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Tgfb2P27090 414 aa29.42■■■□□ 2.3
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Tlr8P58682 1032 aa29.42■■■□□ 2.3
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Flad1Q8R123 492 aa29.42■■■□□ 2.3
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Nip7Q9CXK8 180 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Map4k4P97820 1233 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Zbtb1Q91VL9 713 aa29.41■■■□□ 2.3
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Golga2Q921M4 999 aa29.41■■■□□ 2.3
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 TefQ9JLC6 301 aa29.41■■■□□ 2.3
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Prr29B1ARI9 187 aa29.4■■■□□ 2.3
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Atp1b3P97370 278 aa29.4■■■□□ 2.3
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1810065E05RikQ5NC41 235 aa29.4■■■□□ 2.3
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Gm12185Q5NCB2 835 aa29.4■■■□□ 2.3
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Rbm26Q6NZN0 1012 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Wdhd1P59328 1117 aa29.39■■■□□ 2.3
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Exoc6Q8R313 802 aa29.39■■■□□ 2.3
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Swt1Q9DBQ9 907 aa29.39■■■□□ 2.3
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Cfap70D3YVL2 1141 aa29.38■■■□□ 2.29
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Prim1P20664 417 aa29.38■■■□□ 2.29
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Cnnm1Q0GA42 951 aa29.38■■■□□ 2.29
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Iqsec3Q3TES0 1195 aa29.38■■■□□ 2.29
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Slfnl1Q8BHW9 410 aa29.37■■■□□ 2.29
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ggnbp2Q5SV77 696 aa29.36■■■□□ 2.29
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Srp68Q8BMA6 625 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Nsfl1cQ9CZ44 370 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Rapgef4Q9EQZ6 1011 aa29.35■■■□□ 2.29
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Irx6Q9ER75 438 aa29.35■■■□□ 2.29
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Dpf1Q9QX66 387 aa29.35■■■□□ 2.29
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Zscan21Q07231 555 aa29.34■■■□□ 2.29
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Rnaseh2aQ9CWY8 301 aa29.34■■■□□ 2.29
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Gigyf1Q99MR1 1044 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Camkk2Q8C078 588 aa29.32■■■□□ 2.28
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Trip6Q9Z1Y4 480 aa29.32■■■□□ 2.28
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ubn2Q80WC1 1314 aa29.31■■■□□ 2.28
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Col1a2Q01149 1372 aa29.3■■■□□ 2.28
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Gpr162Q3UN16 588 aa29.3■■■□□ 2.28
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 CastP51125 788 aa29.29■■■□□ 2.28
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Eif4a1P60843 406 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Cyp2c67Q569X9 491 aa29.29■■■□□ 2.28
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 SnrkQ8VDU5 748 aa29.29■■■□□ 2.28
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Prr5lA2AVJ5 370 aa29.28■■■□□ 2.28
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Dusp27Q148W8 1138 aa29.28■■■□□ 2.28
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Taf7Q9R1C0 341 aa29.28■■■□□ 2.28
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Togaram1Q6A070 1776 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Esx1O88933 382 aa29.27■■■□□ 2.28
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Taf1dQ9D4V4 322 aa29.27■■■□□ 2.28
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Prkab2Q6PAM0 271 aa29.26■■■□□ 2.27
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Foxp4Q9DBY0 795 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Uhrf1bp1B2KF50 1429 aa29.25■■■□□ 2.27
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Prdm11A2AGX3 565 aa29.24■■■□□ 2.27
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Strn4P58404 760 aa29.24■■■□□ 2.27
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 GckrQ91X44 587 aa29.24■■■□□ 2.27
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Pdia6Q922R8 440 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Cyp2c69E9PXC3 491 aa29.22■■■□□ 2.27
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Cyp2c40P56657 491 aa29.22■■■□□ 2.27
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Esco1Q69Z69 843 aa29.21■■■□□ 2.27
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Tktl2Q9D4D4 627 aa29.2■■■□□ 2.26
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Uspl1Q3ULM6 1089 aa29.19■■■□□ 2.26
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Slf2Q6P9P0 1278 aa29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 46.2 ms