Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms