Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CROTQ9UKG9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CROTQ9UKG9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CROTQ9UKG9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CROTQ9UKG9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CROTQ9UKG9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CROTQ9UKG9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CROTQ9UKG9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CROTQ9UKG9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CROTQ9UKG9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CROTQ9UKG9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CROTQ9UKG9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CROTQ9UKG9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CROTQ9UKG9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CROTQ9UKG9 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CROTQ9UKG9 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CROTQ9UKG9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CROTQ9UKG9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CROTQ9UKG9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CROTQ9UKG9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CROTQ9UKG9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CROTQ9UKG9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CROTQ9UKG9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CROTQ9UKG9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CROTQ9UKG9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CROTQ9UKG9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CROTQ9UKG9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CROTQ9UKG9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CROTQ9UKG9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CROTQ9UKG9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CROTQ9UKG9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms