Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA4

AKAP11, A-kinase anchor protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP11Q9UKA4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
AKAP11Q9UKA4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
AKAP11Q9UKA4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AKAP11Q9UKA4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AKAP11Q9UKA4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AKAP11Q9UKA4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AKAP11Q9UKA4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AKAP11Q9UKA4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AKAP11Q9UKA4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AKAP11Q9UKA4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AKAP11Q9UKA4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AKAP11Q9UKA4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AKAP11Q9UKA4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AKAP11Q9UKA4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AKAP11Q9UKA4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AKAP11Q9UKA4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AKAP11Q9UKA4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AKAP11Q9UKA4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AKAP11Q9UKA4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AKAP11Q9UKA4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms