Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV9

PFDN2, Prefoldin subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN2Q9UHV9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN2Q9UHV9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms