Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms