Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
POLKQ9UBT6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC25■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC25■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLKQ9UBT6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms