Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTN3Q9P232 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTN3Q9P232 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTN3Q9P232 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTN3Q9P232 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTN3Q9P232 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTN3Q9P232 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTN3Q9P232 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTN3Q9P232 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTN3Q9P232 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTN3Q9P232 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTN3Q9P232 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTN3Q9P232 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTN3Q9P232 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTN3Q9P232 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTN3Q9P232 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTN3Q9P232 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTN3Q9P232 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTN3Q9P232 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTN3Q9P232 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTN3Q9P232 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTN3Q9P232 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTN3Q9P232 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CNTN3Q9P232 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms