Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC88CQ9P219 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms