Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms