Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP4Q9P0V3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms