Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms