Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
FAM53CQ9NYF3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM53CQ9NYF3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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