Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms