Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTX5

ECHDC1, Ethylmalonyl-CoA decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1Q9NTX5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECHDC1Q9NTX5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ECHDC1Q9NTX5 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ECHDC1Q9NTX5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ECHDC1Q9NTX5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ECHDC1Q9NTX5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ECHDC1Q9NTX5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECHDC1Q9NTX5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECHDC1Q9NTX5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECHDC1Q9NTX5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECHDC1Q9NTX5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECHDC1Q9NTX5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECHDC1Q9NTX5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECHDC1Q9NTX5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECHDC1Q9NTX5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECHDC1Q9NTX5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECHDC1Q9NTX5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECHDC1Q9NTX5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECHDC1Q9NTX5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ECHDC1Q9NTX5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECHDC1Q9NTX5 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECHDC1Q9NTX5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECHDC1Q9NTX5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECHDC1Q9NTX5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECHDC1Q9NTX5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECHDC1Q9NTX5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECHDC1Q9NTX5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECHDC1Q9NTX5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms