Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms