Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKDREJQ9NTG1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms