Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms