Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms