Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASCL3Q9NQ33 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms