Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRHQ9HD43 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms