Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC90BQ9GZT6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms