Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LNPKQ9C0E8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms